Ingénieur d'études (H/F) en Bio-informatique/ Biologie computationnelle

Référence : UMR5077-MARPEL1-011

  • Fonction publique : Fonction publique de l'État
  • Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
  • Localisation : 31062 TOULOUSE (France)
Domaine : Recherche
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  • Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
  • Nature du contrat Non renseigné
  • Expérience souhaitée Non renseigné
  • Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) Entre 2349.06 € et 2472.42 € brut mensuel selon expérience € brut/an
  • Catégorie Catégorie A (cadre)
  • Management Non renseigné
  • Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

Missions :
L’agent.e aura pour mission de contribuer à la modélisation computationnelle des maladies complexes, ainsi qu’au traitement bio-informatique et statistique de données omiques.
Le travail sera ciblé autour des objectifs du projet DIOGENES:
https://www.fc3r.com/approches-numeriques-3-2023.html

Activités :
Activités principales (liste non limitative) :
• Développer des approches systémiques computationnelles pour la modélisation et la simulation de maladies complexes.
• Elaborer des pipelines bio-informatiques pour l’analyse et l’intégration de données omiques (données d’expression génique, données génomiques, métabolomiques, protéomiques).
• Favoriser le développement concerté d'outils et leur mise à disposition à l'ensemble du laboratoire.
• Mettre en place et maintenir des machines virtuelles sur le cloud/cluster pour le calcul scientifique.
• Participer à la rédaction de manuscrits scientifiques.

Activités associées/complémentaires :
• Organiser la veille scientifique et technologique.
• Former les membres du laboratoire aux principes et à la mise en œuvre d’outils développés en interne ou nouvellement utilisés par la communauté scientifique.
• Diffuser et valoriser les résultats sous forme de rapports techniques et/ou de présentations orales.
• Encadrement d’étudiants en Licence et Master pour leur stage pratique et leur restitution écrite et orale.

Contexte de travail :
L'agent.e va travailler au Pole de Biologie des Systèmes sous la direction de la Professeure, Mme Anna Niarakis
https://cbi-toulouse.fr/fr/equipe-niarakis

Profil recherché

Competences :
Connaissance, savoir :
• Connaissances théoriques générales dans le domaine des sciences de la vie (biologie intégrative, biologie cellulaire, biologie des systèmes).
• Connaissance pratique approfondie de logiciels appropriés aux analyses des données -omiques, des logiciels de l’analyse de réseaux et de modélisation computationnelle des maladies complexes.
• Connaissance théorique et pratique en programmation et statistique (langages R, python, bash).
• Connaissance de la déontologie, de l'éthique, de la loi et de la réglementation concernant le domaine de recherche (en particulier sur la confidentialité, sécurité informatique, sauvegarde et protection des données).

Savoir-faire :
• Motiver ses choix techniques auprès des responsables de projets.
• Travailler en interaction à la fois avec des biologistes expérimentaux, et des bio-informaticiens.
• Maîtriser les différents environnements OS, comme Mac, Windows, UNIX.
• Gérer les situations d'urgences et hiérarchiser les priorités.
• Maîtriser l'anglais à l'oral et à l'écrit.
Savoir être : Autonomie, capacité à travailler en équipe

Diplôme : Licence requise et Master souhaité

Qualification/Formation : Bio-informatique/Biologie computationnelle des systèmes

Contraintes et risques :

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents
  • Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)

Langues

  • Français Seuil

Qui sommes-nous ?

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.

C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.

En savoir plus sur l'employeur

À propos de l'offre

  • Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

  • Vacant

  • Experte / Expert en biologie - SVT

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