Analyste de données de biodiversité moléculaire marine (H/F)

Missions :
L'ingénieur(e) sera responsable de l'analyse et de l'intégration de données de metabarcoding dans le cadre du programme AO-EMBRC et d'autres projets associés, au sein du Laboratoire à Roscoff
Activités :
- Intégrer et analyser de nouvelles données de metabarcoding dans le cadre de AO EMBRC et de l’ANR BONUS.
- Contribuer à la production d’articles scientifiques via la production de figures et d’analyses statistiques associées
- Utiliser et prendre part au développement de workflows de traitement de données de metabarcoding dont un dédié aux données virales
- Participer au développement de nouvelles fonctionnalités pour améliorer la visualisation des données, faciliter leur analyse au sein des portails, accroître l’interopérabilité entre les différents portails et outils.
- Interagir avec les groupes de recherche participants au programme AO-EMBRC et les ingénieurs de la plateforme ABiMS pour définir et affiner les besoins futurs.
- Participer à la diffusion et valorisation des résultats et réalisations technologiques sous forme de rapports, publications, présentations orales.

Contexte de travail :
Au sein de la plateforme ABiMS de bioinformatique et de gestion de données marines de la station biologique de Roscoff , l’ingénieur(e) recruté(e) travaillera dans la cadre des deux projets PIA AO-EMBRC et ANR BONUS. Le projet « Observatoires Augmentés du Centre National de Ressources Biologiques Marines (EMBRC-France) », AO-EMBRC, vise à soutenir et développer des observatoires augmentés de biologie marine en France, afin de mener des études de suivi temporel des communautés d’organismes marins sur plusieurs sites des côtes métropolitaines.
Dans ce contexte, l’ingénieur(e) recruté(e) sera en charge de l’intégration, du traitement et d’une partie de l’analyse des données de biodiversité moléculaire (metabarcoding) depuis leur collecte sur les sites étudiés jusqu’à leur mise à disposition au sein de la communauté scientifique partenaire du projet puis leur diffusion à l’ensemble de la communauté scientifique au travers des entrepôts de données existants.
Dans le contexte du projet ANR BONUS (porté par Anne Claire Baudoux, UMR 7144), un suivi temporel de diversité moléculaire de virus de microalgues dominantes (diatomées) sera plus spécifiquement étudiée par des approches innovantes dans des échantillons d’eau de mer prélevés au large de Roscoff.
L’ingénieur(e) sera localisé(e) à la Station Biologique de Roscoff, au sein de la plateforme ABiMS, avec de fortes interactions avec les équipes de recherche de la station, les autres stations de biologie marine (Banyuls-sur-mer et Villefranche-sur-mer) ainsi qu’avec le CEA / Genoscope à Evry.
L’ingénieur(e) sera sous la responsabilité de technique de l’ingénieur en charge du traitement des données de diversité au sein de l’équipe, et sous l'autorité hiérarchique du responsable de service.
À l’issue de ce contrat, une poursuite jusqu’à fin déce
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