Assistant Ingénieur en Microbiologie Environnementale et Moléculaire (H/F)
Référence : UMR7564-XAVBEL-005
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 54505 VANDOEUVRE LES NANCY (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
- Nature du contrat Non renseigné
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels environ 2300 € brut mensuel € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Missions :
L’approche One Health est reconnue comme la méthode la plus pertinente pour étudier la dissémination de l’antibiorésistance qui atteint des niveaux très préoccupants. L’offre d’emploi proposée s'inscrit dans le projet AntiobioOne, financé par l’Agence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’alimentation, de l’environnement et du travail (ANSES), dont le but est d’étudier le devenir de l’antibiorésistance et les communautés microbiennes dans une zone humide artificielle de grande taille recevant les eaux usées traitées d’une grande agglomération française et chez la faune sauvage y résidant. Le LCPME travaille sur ce site depuis quelques années avec plusieurs partenaires des domaines médical, vétérinaire ou scientifique.
La personne recrutée rejoindra l’équipe de Microbiologie Environnementale (MIC) du LCPME pour tout d’abord rechercher, dans les eaux et les fèces d’animaux sauvages collectées, la présence de gènes d’antibiorésistance et d’éléments génétiques mobiles vecteurs d’antibiorésistance en collaboration avec les partenaires du projet. Ces données seront comparées à celles obtenues avec des échantillons collectés dans une zone naturelle protégée à proximité du site d’étude. La personne recrutée sera également impliquée dans des expériences menées au LCPME avec des bioréacteurs permettant d’étudier plusieurs mécanismes de transferts horizontaux d’éléments génétiques mobiles vecteurs d’antibiorésistance par des méthodes de biologie moléculaire.
Activités :
Activités principales :
- Participation aux campagnes de terrain mensuelles pour collecter les échantillons d’eaux et de fèces
- Extraction d’ADN de communautés microbiennes environnementales (bactéries, phages et ADN dissouts)
- Expérimentation en bioréacteurs pour le suivi de transferts horizontaux d’éléments génétiques mobiles
- Séquençage par approche long-read et analyse bio-informatique des séquences obtenues
- Envois réguliers d’échantillons ou d’extraits d’ADN aux partenaires du projet
- Enregistrement et présentation des résultats, réalisation de rapports
Activités complémentaires :
- Appliquer les règles d'hygiène et de sécurité correspondantes aux situations de travail
- Gérer et organiser les stocks de matériel du laboratoire (inventaire, préparation des commandes, rangement) liés au projet
Contexte de travail :
La personne retenue sera affectée au Laboratoire de Chimie Physique et Microbiologie pour les Matériaux et l’Environnement (LCPME, UMR 7564 UL-CNRS) qui regroupe environ 80 personnes distribuées dans trois équipes de physico-chimie (spectroscopies et électrochimie) et microbiologie (bactériologie et virologie). La personne recrutée intègrera l'équipe de Microbiologie Environnementale (MIC) sur sa thématique " dissémination d’éléments génétiques mobiles (vecteurs d’antibiorésistance) d’origine anthropique dans l’environnement" sous la direction de Xavier Bellanger (Maître de Conférences HDR). La personne ser
Voir plus sur le site emploi.cnrs.fr...
Profil recherché
Competences :
Connaissances :
- Microbiologie (notions avancées)
- Biologie moléculaire (notions avancées, notamment en PCR quantitative et/ou digitale)
- Bio-informatique (notions avancées, notamment en analyse de métagénomes)
- Informatique et acquisition de données expérimentales (notions de base)
Compétences opérationnelles :
- Rigueur scientifique
- Appliquer des techniques de microbiologie et biologie moléculaire (travail sous PSM, réalisation de PCR …)
- Suivre un mode opératoire (préparation d'échantillons, maintenance d’équipements, ….)
- Prévoir les besoins en produits et matériel
- Appliquer les règles d'hygiène et de sécurité en laboratoire L2
- Utiliser, régler des instruments simples de laboratoire
Compétences relationnelles :
- Sens de l'organisation
- Réactivité
- Autonomie
- Communication
Contraintes et risques :
Sorties mensuelles sur le terrain d'1 jour ou 2 (par 2 personnes au minimum à chaque fois)
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 5 Diplômes de niveau bac +2
- Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Experte / Expert en expérimentation, instrumentation et techniques biologiques
