Assistant Ingénieur (H/F)
Référence : UMR7622-CLECAR-002
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 75252 PARIS 05 (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
- Nature du contrat Non renseigné
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) 1900 et 2100 Euros brut mensuel € brut/an
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Missions :
Analyse de données bio-informatique de type séquençage (RNAseq, small RNAseq, chIPseq, tRNA-seq) dans le cadre de projet sur les petits ARN non-codants et modification des ARN sur 2 systèmes modèles différents: D. melanogaster et cellule humaine.
Activités :
- Technique classiques d'analyse bio-informatique
- connaissance avancée en R, RNA sequencing analysis, fragments files, ATAC-seq, analyse et manipulation d'objet, GWAS manipulation (phénotypique et génotypes)
- connaissance de création de plots (ggplot2 ou équivalent)
- connaissance en spatial transcriptomics
- Niveau avancé en Python (Syntaxe des fonctions, sérialisation des objets python, manipulation des listes et des tableaux)
- Niveau avancé en Bash/UNIX (programmation, analyse de fichiers big data et installation de packages)
- connaissance requise en C++, Github/Git - principes FAIR et Docker
- Interactions avec les plateformes de séquençage et possiblement de protéomique
- connaissance et utilisation de Galaxy pour analyse RNAseq (small and others).
Contexte de travail :
Activité dans l'équipe TE R BIO : "TRANSGENERATIONAL EPIGENETICS & SMALL RNA BIOLOGY" dirigée par C. Carré et L. Teysset au Laboratoire de Biologie du Développement (UMR7622), à l'Institut de Biologie Paris Seine, sur le campus Pierre et Marie Curie de Sorbonne Université (Bâtiment Cassan).
Profil recherché
Competences :
Compétences en bio-informatique, séquençage et analyse de séquence
Savoir-faire: Lecture et compréhension de protocoles/ programmes publiés, optimisation de protocoles et programmes informatiques (échange en Anglais et Français, niveau C1 Anglais minimum).
Savoirs-être: Rigueur, autonomie, dynamisme, très bonne capacité à travailler en équipe
Contraintes et risques :
Habituelles d'un travail de recherche en bio-informatique dans en laboratoire de Biologie.
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents
- Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Experte / Expert en biologie - SVT