Biologie des systèmes en physiopathologie H/F

Résumé du projet scientifique :
La compréhension des mécanismes du vivant et de ses dysfonctionnements nécessite une approche intégrée combinant génomique, transcriptomique, protéomique et métabolomique. L’analyse et l’intégration de ces données hétérogènes et multi-échelles pour élucider les mécanismes systémiques requièrent des avancées en sciences informatiques et mathématiques. Ce projet interdisciplinaire vise, grâce à des approches computationnelles, au développement d'algorithmes pour l’analyse multi-échelle et l’apprentissage automatique, à approfondir la compréhension de la physiologie humaine et à concevoir des solutions diagnostiques et thérapeutiques innovantes.
Le candidat devra établir des collaborations avec les équipes de recherche de l’INEM afin de stimuler et structurer ces travaux interdisciplinaires.
Résumé du projet d'enseignement :
Le projet pourra s’intégrer dans l’enseignement de l’Université de Paris Cité au sein des équipes pédagogiques en charge des enseignements en Sciences, Technologie, Santé.
Stratégie de l'établissement :
Ces dernières années ont été marquées par des avancées majeures dans les domaines de la transcriptomique, de la métabolomique et de la protéomique. Ces approches offrent des outils puissants pour étudier les bases moléculaires et cellulaires du fonctionnement des organes et pour mieux comprendre leurs dysfonctionnements dans des conditions pathologiques. L'intégration de ces données, à la fois hétérogènes et multi-échelles, pour élucider les mécanismes systémiques nécessite le développement de nouvelles approches en sciences informatiques et mathématiques. Cette démarche, qui s'inscrit dans le cadre de la biologie des systèmes, représente un domaine émergent et stratégique qu'il est impératif de renforcer au niveau national pour maintenir le leadership scientifique de CNRS Biologie, tant sur le plan national qu'international.
En 2023, sous l’impulsion de Sagi Shapira (INEM), expert de renommée internationale en biologie des systèmes, CNRS Biologie a créé la Fédération de Recherche « Paris Quantitative Biology Initiative ». Cette fédération regroupe les équipes de l’INEM, de l’Institut Imagine et de l’Institut Pasteur, avec pour ambition de favoriser les synergies entre les équipes situées sur le campus Necker développant des approches innovantes en biologie des systèmes. Suite au départ de Sagi Shapira, la direction de cette fédération a été confiée à Nicolas Venteclef, chercheur à l’INEM. Afin de renforcer la dynamique scientifique initiée et d'assurer le développement de ce domaine d'excellence, il est essentiel de recruter de nouvelles équipes spécialisées dans la biologie des systèmes. Dans cette perspective, une chaire de professeur junior sera créée au sein de l’INEM (UMR 8253).

Stragtégie du Laboratoire :
L’INEM) est reconnu, tant au niveau national qu’international, pour l’excellence de ses travaux en physiopathologie humaine. Ces recherches allient une recherche fondamentale de premier plan et, grâce à sa proximité avec l’hôpital Necker, une recherche translationnelle de très grande qualité, centrée sur les syndromes métaboliques, les maladies chroniques et les pathologies du système immunitaire, qu’elles soient héréditaires ou acquises.
Ces dernières années, les équipes de recherche de l’INEM ont initié des études multi-omiques, témoignant de leur volonté de renforcer ces approches par le développement d’un axe stratégique en biologie des systèmes. Afin d’accompagner cette évolution et de consolider la visibilité internationale de l’INEM dans ce domaine en plein essor et à fort enjeu stratégique, CNRS Biologie ambitionne de recruter une équipe de recherche spécialisée en biologie des systèmes appliquée à la physiopathologie ou à l’immunologie pour cette unité.