CDD - Chargé(e) de mission "R&D Observation des poissons récifaux" H/F
Référence : 2024-1723041
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Office Français de la Biodiversité (OFB)
- Localisation : Station Marine de Dinard (35)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
- Nature du contrat Non renseigné
- Expérience souhaitée Non renseigné
-
Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) Non renseigné
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Mission
Au sein de la cellule « poissons côtiers et espèces patrimoniales » de PatriNat, hébergée à la station Marine de Dinard du MNHN, la personne titulaire sera principalement en charge de la gestion et l’analyse des données UVC, caméra appâtée et eDNA collectées par l’OFB et les autres partenaires du programme Eurockfish, et par PatriNat dans le cadre de ses projets connexes.
Activités principales
Responsable de la gestion des données :
- Afin de centraliser (de manière inter-opérable entre protocoles et entre partenaires) les données et métadonnées collectées par les différents partenaires pour les différents protocoels, fournir aux partenaires les standards et référentiels nécessaires pour qu’ils puissent chacun assurer la saisie numérique et la consolidation de leurs métadonnées (des 3 protocoles) et de leurs données d’abondances par taxons, issues des comptages visuels et comptages vidéos (les données d’occurrences issues de l’ADNe étant déjà centralisées par le prestataire)
- Multi-formatage des données d’occurrences/abondances issues des 3 méthodes, aux formats « tableur plat » pour les analyse sous R et « DarwinCore» pour la bancarisation GBIF, en lien avec l’équipe données de PatriNat.
- Etude de la faisabilité de déposer les données « brutes » issues des caméras appâtées et des séquençages ADNe sur plateforme de type Indores (les données UVC brutes sont déjà des données d’occurrences/abondances et seront directement bancarisées dans GBIF)
Responsable des analyses biostatistiques des données d’occurrences :
- Tester les complémentarités des 3 méthodes pour évaluer l’état écologiques des peuplements de poissons
- Dégager de nouvelles connaissances écologiques sur la distribution spatiale des poissons à l’échelle européenne
- Valorisation des analyses, par des communications écrites et orales, et par une contribution soutenue à la rédaction du guide méthodologique Eurockfish
Prospectives méthodologiques et partenariales :
- Participer sur le terrain à des tests d’intercalibration entre les méthodes Eurockfish et d’autres méthodes existantes, en particulier celle développées dans le cadre du programme Biodiversa+ CAMBioMed (call BiodivMon)
- Contribuer à la recherche de moyens pour la pérennisation et extension du réseau de partenaires Eurockfish
Livrables :
- Jeux de données d’occurrences/abondances consolidées, présentés aux formats tableur plat (R) et DarwinCore (GBIF)
- Jeux de données bruts issues des caméras appâtées et des séquençages ADNe déposés sur plateforme de type Indores
- Scripts Rstudio annotés permettant de renouveler aisément les travaux de bancarisation et analyses
- Data paper présentant ces jeux de données
- Rapport d’analyse et interprétation écologique
- Guide méthodologique, co-rédigé avec le coordinateur OFB du projet
Profil recherché
- Diplôme de niveau BAC +5 en écologie et/ou biostatistiques
- Diplôme de plongée professionnelle Mention B Classe 2 minimum. Diplôme de plongée en recycleur CCR, diluant trimix normoxique minimum.
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents
Compétences attendues
Connaissances :
Connaissances dans la structuration de jeux de données croisant traits x espèces x environnement
Connaissance en théorie de l'échantillonnage et écologie des communautés
Méthodes avancées en analyses uni- et multivariées des données traits x espèces x environnement
Savoir-faire opérationnel :
Savoir utiliser le logiciel de biostatistiques Rstudio
Rédiger des métadonnées, utiliser les référentiels, standardiser les données
Posséder des compétences en outils bureautiques, notamment une maîtrise des fonctionnalités avancées de MS Word et MS Excel
Avoir une bonne capacité de rédaction scientifique en français comme en anglais
Mettre en œuvre des méthodes utilisées dans Eurockfish (i.e. UVC, eDNA et caméras appâtées, incluant la plongée sous-marine en recycleur circuit fermé avec diluant trimix hypoxique)
Savoir-être professionnel :
Forte capacité de travail en autonomie sur ordinateur.
Éléments de candidature
Documents à transmettre
Qui sommes-nous ?
Créé le 1er janvier 2020, l’Office français de la biodiversité (OFB) est un établissement public administratif dédié à la sauvegarde de la biodiversité sous la tutelle des ministres chargés de l’environnement et de l’agriculture. Doté d’un budget de 492 millions d’euros (budget initial 2022), il s’appuie sur l’expertise de près de 3 000 agents, dont une grande partie agit sur le terrain avec, notamment, 1 700 inspecteurs de l’environnement.
L’établissement est au cœur de l’action pour la préservation du vivant dans les milieux aquatiques, terrestres et marins, tant en métropole que dans les Outre-mer. Les équipes interviennent chaque jour pour lutter contre l’érosion de la biodiversité face aux pressions exercées par la destruction et la fragmentation des milieux naturels, les multiples pollutions, la surexploitation des ressources naturelles, les conséquences du changement climatique, l’introduction d’espèces exotiques envahissantes.
A ce titre, l’OFB est responsable de 5 missions complémentaires :
- la police de l’environnement et la police sanitaire de la faune sauvage
- la connaissance, la recherche et l’expertise sur les espèces, les milieux et leurs usages
- l’appui à la mise en œuvre des politiques publiques
- la gestion et l’appui aux gestionnaires d’espaces naturels
- l’appui aux acteurs et la mobilisation de la société
Descriptif du service
Le Partenariat Biodiversa + :
L’OFB est engagé dans un partenariat européen Biodiversa+ suite à un appel d’offres de la Commission euro-péenne en 2021 ("European partnership rescuing biodiversity to safeguard life on Earth"). Ce partenariat est financé par le programme cadre Horizon Europe HORIZON-CL6-2021-BIODIV-02-01. Il rassemble 75 partenaires de 37 pays principalement européens. La coordination est assurée par la Politique scientifique fédérale (BELSPO) en Belgique et la Fondation pour la Recherche Scientifique (FRB) en France. L’OFB est engagé dans le partenariat sur le package 2 « Promouvoir et soutenir la surveillance transnationale de la biodiversité » et a la responsabilité de la tâche 2.1 « Définir des priorités partagées, une couverture adéquate et des indicateurs pour la surveillance de la biodiversité pour mieux correspondre aux besoins de recherche, de la société et des politiques publiques », de la sous-tâche 2.1.1 « Préciser les priorités et besoins pour un couverture adéquate de la surveillance pour mieux correspondre aux besoins de recherche, de la société et des politiques publiques », et de la sous-tâche 2.2.1 « Harmoniser les protocoles opérationnels et les méthodes d’inventaires entres les régions et les pays ».
Le projet EuRockFish :
Dans ce cadre, l’OFB coordonne une étude pilote lancée en 2024 par
Biodiversa+ sur la standardisation des mé-thodes de surveillance des
peuplements de poissons associés aux milieux côtiers rocheux.
À propos de l'offre
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Positionnement hiérarchique : Sous l’autorité du chef d'équipe Milieux Marins - PatriNat.
Conditions d’emploi : Recrutement sur projet de 12 mois ; soit par un contractuel (rémunération selon expérience professionnelle comprise entre 2 399€ et 3 233€ bruts mensuels), soit par un fonctionnaire en détachement sur contrat.
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La/le titulaire du poste sera affecté(e) à la DSUED, unité PatriNat, équipe Milieux Marins, Cellule Poissons Côtiers. Elle/il sera hébergé(e) au sein de la station marine de Dinard du MNHN.
Elle/il sera sous l’autorité hiérarchique du chef de l’équipe milieux marin et sous l’autorité fonctionnelle du Réfé-rent Ecologie des poissons récifaux. Elle/il devra par ailleurs respecter les règles d’accueil dictées par le chef de la station marine de Dinard.
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Vacant à partir du 01/01/2025
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Chargée / Chargé de politique environnementale
