Chargé de projet en bio-informatique & métagénomique virale (H/F)

Référence : 2023-1269738

  • Fonction publique : Fonction publique de l'État
  • Employeur : Agence Nationale de Sécurité Sanitaire de l'Alimentation, de l'Environnement et du Travail (ANSES)
  • Localisation : CLERMONT FERRAND
Domaine : Recherche

Date limite de candidature : 21/07/2023

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  • Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
  • Nature du contrat

    CDD de 6 mois
  • Expérience souhaitée Débutant
  • Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) Non renseigné
  • Catégorie Catégorie A (cadre)
  • Management Non
  • Télétravail possible Oui

Vos missions en quelques mots

Dans le cadre d’un projet collaboratif international initié en 2020, et afin d’évaluer le statut sanitaire de plants d’agrumes prélevés en Arabie Saoudite, vous serez amené(e) à analyser des jeux de données issues du séquençage Illumina d’extraits d’ARN totaux ribodéplétés. Ce travail inclut la poursuite du développement d’un pipeline bio-informatique dédié à la détection des virus et viroïdes des plantes ; l’analyse et l’interprétation des données ; la synthèse des résultats et la préparation de leur valorisation sous forme d’article(s) scientifique(s).

Profil recherché

Formation et expérience requises :

-        Minimum Bac + 3.

-        Bac +5 Souhaité en lien avec le profil recherché

-        Une qualification ou une expérience complémentaire sera appréciée (CDD ingénieur, doctorat et/ou CDD post-doctoraux)

-        Un bon niveau en anglais scientifique

-        Une expérience significative en métagénomique virale et/ou en analyse de données bio-informatiques serait appréciée

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents
  • Spécialisation Santé

Éléments de candidature

Documents à transmettre

Pour postuler à cette offre, l'envoi du CV et d'une lettre de motivation est obligatoire

Qui sommes-nous ?

Descriptif du service

Au sein de ce laboratoire, l’Unité de Quarantaine est chargée de la mise en quarantaine des végétaux introduits sur le territoire français. Cette activité concerne des végétaux destinés à la recherche scientifique ou à la création variétale, et appartenant principalement aux genres suivants : Citrus, Malus, Prunus, Pyrus, Solanum et Vitis. L’Unité réalise un ensemble d’opérations culturales sous confinement (ex : culture in vitro, indexages biologiques, greffage, suivi sanitaire) et réalise le diagnostic sanitaire des végétaux qu’elle héberge, notamment vis-à-vis de virus et bactéries endophytes. Les analyses de laboratoire sont classiquement menées par ELISA, par PCR conventionnelle et PCR temps réel. Aussi, le développement du diagnostic sanitaire par séquençage à haut-débit est en cours, grâce au recrutement récent d’une bio-informaticienne. En parallèle, l’Unité de Quarantaine réalise des d’expertises et participe à des projets de recherche dans le domaine des organismes nuisibles de quarantaine et du confinement. Elle est laboratoire national de référence pour le virus de la Sharka, les virus de la pomme de terre et les virus des agrumes.

À propos de l'offre

  • Déplacements possibles

  • Susceptible d'être vacant à partir du 02/07/2023

  • Chercheuse / Chercheur

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