Chargé de projet en génomique comparative / bio-informatique (H/F)

Référence : 2022-821183

  • Fonction publique : Fonction publique de l'État
  • Employeur : Agence Nationale de Sécurité Sanitaire de l'Alimentation, de l'Environnement et du Travail (ANSES)
  • Localisation : FOUGERES (35)
Domaine : Recherche

Date limite de candidature : 29/04/2022

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  • Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
  • Nature du contrat

    CDD d'1 an
  • Expérience souhaitée Confirmé
  • Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) à partir de 35000/an € brut/an
  • Catégorie Catégorie A (cadre)
  • Management Non
  • Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

Le poste proposé s’intègre au projet ANR BAoBAb (2022-2025) démarré en janvier 2022 et qui a pour objectif de mieux comprendre ces stratégies d'adaptation bactérienne en biofilm vis-à-vis de biocides utilisés en industries alimentaires et d’évaluer l’impact de cette adaptation collective sur l’émergence de l’antibiorésistance. Une thèse démarrée en octobre 2021 en collaboration avec l’INRAe dans le cadre de BAoBAb réalise des expérimentations d’évolution dirigée en laboratoire en exposant des biofilms de plusieurs souches d’Escherichia coli à des biocides couramment utilisés sur la chaine alimentaire afin de sélectionner des variants résistants à différents antibiotiques. Les génomes complets des variants et de leur souches parentales (200 à 250) seront séquencés dans le cadre du projet dans le courant de l’année 2022.

A ce titre, vous serez chargé de la mise en place des analyses génomiques et bio-informatiques permettant de comparer les génomes des variants et des souches parentales et d’identifier les gènes et voies de régulation génétiques impactés par l’adaptation aux biocides et jouant un rôle dans la résistance aux antibiotiques ainsi que la formation de biofilms et la capacité de dissémination des variants. L’intégration de ces approches génomiques comparative et des caractérisations phénotypiques réalisées dans le projet BAoBAb permettra in fine d’identifier des marqueurs moléculaires récurrents de l’adaptation et du développement de résistance croisée qui pourront servir au développement d’outils de surveillance sur la chaîne alimentaire

Profil recherché

Diplômes requis : Bac + 3 à Bac + 5 - Thèse de doctorat en génomique/bio-informatique appréciée

 
Expériences similaires

-       Expériences en génomique et bio-informatique

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents
  • Spécialisation Chimie-biologie, biochimie

Compétences attendues

-       Compétences scientifiques et techniques en bio-informatique et analyse de données NGS

-       Expertise et autonomie en génomique comparative

-       Intérêt pour la problématique des biofilms et de la résistance aux antimicrobiens

-       Aptitude à l'analyse bibliographique

-       Maitrise de l'anglais

-       Travail en équipe

-       Qualité rédactionnelle,

-       Autonomie et initiative

Localisation

Localisation : ANSES FOUGERES

Éléments de candidature

Documents à transmettre

Pour postuler à cette offre, l'envoi du CV et d'une lettre de motivation est obligatoire

Qui sommes-nous ?

L’Agence nationale de sécurité sanitaire de l’alimentation, de l’environnement et du travail (Anses) est un établissement public administratif placé sous la tutelle des ministères chargés de l’agriculture, de la consommation, de l’environnement, de la santé et du travail. Elle intervient dans les domaines de la santé au travail, de l'environnement, de l'alimentation, de la santé et du bien-être des animaux, de la santé des végétaux avec un objectif prioritaire : contribuer à assurer la sécurité des travailleurs et des consommateurs.

À propos de l'offre

  • Catégorie d’emploi
    Agent contractuel de catégorie 2
    Type de contrat
    Contrat à durée déterminée de droit public de 12 mois
    Localisation
    Fougères (35)
    Prise de fonction
    Septembre 2022
    Rémunération
    selon l’expérience et le niveau de formation par référence aux grilles indiciaires des agences sanitaires, en application du décret n° 2003-224 du 7 mars 2003, ou selon statut particulier si fonctionnaire.

    Date limite de réponse : 29 avril 2022

    Renseignements sur le poste : Arnaud BRIDIER, Chargé de projets Recherche (arnaud.bridier@anses.fr )

    Adresser les candidatures par courriel (lettre de motivation + cv) en indiquant la référence 2022-040 à : recrutement@anses.fr

  • En vertu de l'Art L.5323-4 du code la santé publique, le titulaire du poste sera soumis à l'obligation de remplir une déclaration publique d'intérêt. Toute personne recrutée est soumise aux règles de déontologie de l’Anses. Elles garantissent le respect des obligations notamment d’indépendance et de réserve de ses agents

  • Vacant à partir du 01/09/2022

  • Experte / Expert en expérimentation, instrumentation et techniques biologiques

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