Chargé de projet scientifique et technique en bio-analyses (H/F)

Référence : 2022-861677

  • Fonction publique : Fonction publique de l'État
  • Employeur : Agence Nationale de Sécurité Sanitaire de l'Alimentation, de l'Environnement et du Travail (ANSES)
  • Localisation : SOPHIA-ANTIPOLIS (06)
Domaine : Recherche

Date limite de candidature : 14/04/2022

Partager la page

Veuillez pour partager sur Facebook, Twitter et LinkedIn.

  • Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
  • Nature du contrat

    CDD de 3 ans
  • Expérience souhaitée Non renseigné
  • Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) selon l'expérience et le niveau de formation € brut/an
  • Catégorie Catégorie A (cadre)
  • Management Non
  • Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

Sous l’autorité de la cheffe d’unité et en interaction avec les chargés de projet de l’unité, l’agent recruté aura en charge l’exploitation de données issues du séquençage de différents agents pathogènes de l’abeille, tels que des bactéries (ex. Paenibacillus larvae), des acariens (ex. Varroa destructor, Tropilaelaps spp.) ou encore des coléoptères (ex. Aethina tumida).
 

L’agent aura en charge :

-       L’assemblage des génomes issus de différentes technologies (Illumina, MinION...)

Profil recherché

Diplômes requis : Master, doctorat ou diplôme d’ingénieur ; les candidat(e)s devront justifier d'une formation en bio-informatique, suivie d'une expérience en analyse de données dans le domaine du NGS.

Minimum bac +3

 
Expériences similaires

-       Une expérience préalable d'analyse de données et de développement méthodologique est nécessaire (assemblage, annotations structurale et fonctionnelle, génomique comparative à partir de données issues de plateformes de séquençage, principalement Illumina et MinION) ;

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents
  • Spécialisation Spécialités pluriscientifiques

Compétences attendues

- Des connaissances préalables sont requises sur des outils bio-informatiques et des méthodes de traitement de données issues des techniques de séquençages haut débit ;
- Maitrise de l'environnement LiNUX ;
- Maîtrise des outils liés au traitement des données NGS (nettoyage, assemblage, mapping, variant calling…) ;
- Maitrise des pipelines principaux pour l'analyse des données issues de procaryotes et d'eucaryotes ;
- Maîtrise de l'anglais indispensable (communication écrite et orale) ;
- Connaissance de langages de programmation adaptés (idéalement Python, R ou un autre langage d'analyse statistique) ;
- La connaissance de Galaxy, Snakemake, Nextflow et git serait un plus ;
- Capable de mobiliser ses connaissances et son expérience pour développer de nouvelles approches méthodologiques adaptées aux problématiques rencontrées dans le cadre des différents projets ;
- Rigueur, organisation, autonomie ;
- Sens de l'organisation et de la planification ;
- Qualités relationnelles, capacités de dialogue et de travail en équipe, en particulier capacité à conduire différents projets simultanément.

Localisation

Localisation : ANSES SOPHIA-ANTIPOLIS

Éléments de candidature

Documents à transmettre

Pour postuler à cette offre, l'envoi du CV et d'une lettre de motivation est obligatoire

Qui sommes-nous ?

L’Agence nationale de sécurité sanitaire de l’alimentation, de l’environnement et du travail (Anses) est un établissement public administratif placé sous la tutelle des ministères chargés de l’agriculture, de la consommation, de l’environnement, de la santé et du travail. Elle intervient dans les domaines de la santé au travail, de l'environnement, de l'alimentation, de la santé et du bien-être des animaux, de la santé des végétaux avec un objectif prioritaire : contribuer à assurer la sécurité des travailleurs et des consommateurs.

À propos de l'offre

  • Catégorie d’emploi : Agent contractuel de catégorie 2
    Type de contrat : Contrat à durée déterminée de droit public de 3 ans
    Localisation : Sophia Antipolis (06)
    Prise de fonction : Dès que possible
    Rémunération : selon l’expérience et le niveau de formation par référence aux grilles indiciaires des agences sanitaires, en application du décret n° 2003-224 du 7 mars 2003, ou selon statut particulier si fonctionnaire.

    Date limite de réponse : 14 avril 2022

    Renseignements sur le poste : Marie-Pierre Rivière, cheffe de l’unité Pathologie de l’Abeille (marie-pierre.riviere@anses.fr; 06.29.98.18.93)

    Adresser les candidatures par courriel (lettre de motivation + cv) en indiquant la référence 2022-066 à : recrutement@anses.fr

  • Vacant à partir du 16/05/2022

  • Experte / Expert en instrumentation et expérimentation

D'autres offres pourraient vous intéresser