Chargé de recherche - 'Influence des proliférations de cyanobactéries et des métabolites bioactifs' H/F

Objectifs : Le projet décrit ici vise à combler ce manque de connaissances en examinant les effets d'un large spectre de métabolites isolés de différentes espèces de cyanobactéries impliquées dans les épisodes d'efflorescences en région Île-de-France, notamment sur le microbiote des poissons. À travers une combinaison d'expériences menées in vivo sur différentes espèces de poissons et d'études in vitro sur des cultures de bactéries isolées du microbiote intestinal des poissons, et en utilisant des techniques de microbiologie, de chimie analytique et de génomique avancées, le projet cherche à démêler les interactions complexes entre les métabolites cyanobactériens, le microbiote et la santé des poissons. Le projet testera trois hypothèses : (1) Les différentes espèces de cyanobactéries induisent des effets différents sur le microbiote intestinal des poissons ; (2) Les effets positifs ou négatifs sur ces bactéries du microbiote sont dus à l’action de certains métabolites bio-actifs ; (3) Ces métabolites sont susceptibles d’avoir ainsi des effets notables à court et à long terme sur la santé de l’ichtyofaune et sur sa contamination par les cyanotoxines.
Résultats attendus : L’effet des différentes souches et métabolites sur la composition du microbiote intestinal et le niveau de contamination des poissons en cyanotoxines sera évalué. Les tests d'activité antibactérienne mettront en évidence les effets spécifiques des métabolites sur le microbiote des poissons. Les résultats attendus incluent l'identification de nouveaux composés antibactériens ou probiotiques, l'élucidation de leurs mécanismes d'action et l'évaluation de leurs impacts sur la composition du microbiote des poissons et la contamination par les cyanotoxines. Ces résultats conduiront à des publications dans des revues à fort facteur d’impact. Le chargé de recherche recevra une formation complète et des opportunités de participation à des conférences, favorisant à la fois l'expertise technique et les compétences en gestion de projet et contribuant à notre compréhension des interactions entre efflorescences de cyanobactéries, microbiote des poissons et santé des écosystèmes aquatiques.
Le(la) chargé(e) de recherche pilotera les expérimentations des poissons ainsi que des souches de bactéries intestinales sous la supervision des personnels qualifiés de l’animalerie et du service de bactériologie de l’UMR7245 MCAM. Il(elle) sera formé(e) et réalisera les étapes d’extraction de métabolites et d’ADN, de production et d’analyse des données de métabolomique et métagénomique sous la supervision de personnels compétents. Il(elle) interprétera les données et pilotera la rédaction des publications scientifiques de ses résultats.
Le(la) chargé(e) de recherche sera un acteur clé du projet qu’il ou elle portera et animera en interaction avec les différents acteurs et plateaux impliqués, ce qui l’amènera à mobiliser diverses compétences techniques (expérimentation animale, cultures bactériennes (...)