Chercheur en microbiologie anaérobie haute pression - H/F

Missions :
Le poste de chercheur proposé fera partie de la tâche « Modélisation de l'interaction entre les microorganismes et l'H2 dans les environnements profonds » de la chaire ORHYON. Le chercheur sera en charge des aspects microbiologiques. Trois souches microbiennes modèles ont été isolées et caractérisées : une archée méthanogène, une sulfato-réductrice et une homoacétogène. L'effet sur la croissance microbienne de différents paramètres (pressions partielles de H2 et CO2, température, salinité, etc.) sera suivi sur ces souches pures et des co-cultures, révélant ainsi les processus de compétition ou de mutualisme entre les souches. Les résultats de ces expériences seront modélisés à l'aide d'un code de calcul d'IFPEN dédié aux réactions biogéochimiques afin de déterminer les paramètres cinétiques et de les utiliser pour reproduire numériquement les expériences de laboratoire (tâche réalisée par l’IFPEN en tant que partenaire du projet). La capacité de prédiction des modèles sera ensuite évaluée en comparant les résultats des simulations de co-culture (vitesse de consommation des substrats et apparition des produits, variations de la taille des populations, etc.) avec les observations expérimentales.

Des expérimentations en cellules haute pression doivent permettre de réaliser des cultures axéniques et des co-cultures en imposant un écoulement contrôlé au sein de carottes rocheuses, simulant ainsi les transferts de fluides en milieux profonds. La modification des propriétés pétrophysiques induite par le développement microbien sera mesurée par suivi de pression lors des essais, ainsi que par tomographie aux rayons X et analyses RMN (Résonance Magnétique Nucléaire) des carottes en début et en fin d'expérimentation. Toutes les données obtenues seront utilisées pour alimenter des modèles numériques couplant écoulement et réactivité biogéochimique (le chercheur interagira avec un modélisateur).

Activités :
Tâches principales
- Culture, caractérisation physiologique, co-culture de microorganismes anaérobies
- Suivi de croissance, suivi de l’évolution des phases aqueuses et gazeuses des cultures
- Mise au point et utilisation d’une cellule d’écoulement haute pression
- Suivi microscopique de l’état cellulaire
- Rédaction de rapports et d’articles scientifiques dans des revues internationales
- Présentation des résultats aux partenaires de la chaire
Tâches secondaires
- Collaboration avec des modélisateurs
- Collaboration avec des spécialistes en imagerie (Tomographie à Rayons X, RMN)

Contexte de travail :
La chaire industrielle ORHYON s'appuie sur les forces complémentaires d'Engie et de l'UPPA pour ouvrir la voie vers des solutions d’hydrogène durable compétitives (hydrogène naturel, stockage en UGS). Ce projet a débuté en 2020 et s’achèvera en décembre 2026. L’objectif principal est de comprendre la mobilité de l'H2 et la réactivité biochimique dans les milieux poreux naturels, des environ
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