Chercheur post-doc (H/F) en génomique comparative

Référence : UMR7141-INGLAF-002

  • Fonction publique : Fonction publique de l'État
  • Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
  • Localisation : 75005 PARIS 05 (France)

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  • Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
  • Nature du contrat Non renseigné
  • Expérience souhaitée Non renseigné
  • Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels Entre 2 991,58 € et 4 756,76 € bruts mensuels selon l'expérience € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
  • Catégorie Catégorie A (cadre)
  • Management Non renseigné
  • Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

Missions :
L'objective du présent projet est de retracer l’histoire évolutive et comparative des canaux de translocations au sein de la mitochondrie (TOM/TIM pour translocases de la membrane externe/interne de la mitochondrie) et du chloroplaste (TOC/TIC, pour translocases de la membrane externe/interne du chloroplaste) au travers desquels les protéines sont importées au sein de ces organites ; ainsi que des systèmes de translocations bactériens impliqués dans la résistance aux AMP.
Dans cette perspective évolutive, elle/il revisitera l'évolution du cycle de Calvin-Benson (CBC) vers une augmentation de son activité de fixation du CO2. À cette fin, le candidat déduira les séquences ancestrales des enzymes du CBC, afin que les expérimentateurs conçoivent des souches de deux organismes modèles portant ces séquences ancestrales, qui subiront une évolution dirigée et seront sélectionnées pour leur aptitude accrue. Il/elle analysera également les trajectoires mutationnelles des souches évoluées.

Activités :
- Réaliser une bibliographie exhaustive des complexes TIC/TOC, TOM/TIM et des translocons bactériens impliqués dans la résistance aux peptides antimicrobiens.
- Retracer l’histoire évolutive et comparative de ces trois systèmes protéiques
- Effectuer des analyses phylogénétiques sur les enzymes du CBC
- Analyser l’évolution de la structure des génomes d’une population de microalgues au cours d’une expérience d’évolution expérimentale
- Encadrement de stagiaires de M2 possibles

Contexte de travail :
Le travail sera mené au sein du laboratoire d’accueil UMR7141 “Photobiologie et Physiologie des Plastes et des Micro-algues”, dirigé par Dr. Angela Falciatore à l’Institut de Biologie-Physico-chimique à Paris (http://www.ibpc.fr/UMR7141/en/home/). Ce laboratoire, situé au cœur du quartier latin regroupe un peu plus de 30 personnes dont 19 membres statutaires. Il aborde des questions clés sur la biologie, l’évolution et l’écologie des micro-algues en se concentrant sur différentes espèces modèles (p. ex. Chlamydomonas reinhardtii et Phaeodactylum tricornutum) et sur des espèces phytoplanctoniques d’importance écologique, étudiés avec des approches écophysiologiques, biophysiques, biochimiques, génomiques et génétiques. Le projet se fera sous la direction d'Ingrid Lafontaine.

Profil recherché

Competences :
Savoirs/Connaissances :
- Connaissances générales en bioinformatique
- Connaissance approfondie en génomique comparative et évolution des génomes
- Connaissances approfondies en analyse de données NGS
- Connaissances en biologie évolutive
- Maîtrise de l’anglais scientifique (lecture et rédaction)
- Connaissances de base en génétique
Savoir-faire :
- Concevoir et mettre en œuvre les protocoles expérimentaux
- Capacités d'analyse et de restitution des informations (tenue d'un cahier de laboratoire, préparation de tableaux de synthèse des résultats, préparation de présentations orales).
- Préparer des articles pour publication dans des revues internationales à comité de lecture

Savoir-être
- Innovation, rigueur et fiabilité dans l'exécution du travail.
- Sens de l'organisation.
- Aptitude à travailler en équipe


Contraintes et risques :

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
  • Spécialisation Formations générales

Langues

  • Français Seuil

Qui sommes-nous ?

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.

C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.

En savoir plus sur l'employeur

À propos de l'offre

  • Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

  • Vacant
  • Chercheuse / Chercheur

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