Chercheur post-doctorant (H/F) en écologie du plancton côtier utilisant de grands jeux de données d'ima

Missions :
Le poste est centré sur la mission Tara Europa (https://fondationtaraocean.org/en/expedition/tara-europa/), qui échantillonne les côtes de l'Europe au cours des années 2023 et 2024. Les eaux côtières sont échantillonnées dans divers sites et les organismes planctoniques sont imagés à l'aide de différents instruments (IFCB, Flowcam et ZooScan), permettant ainsi d'accéder à un large spectre de tailles d'organismes (de 10 µm à plusieurs mm). De plus, un grand nombre d'autres variables sont échantillonnées (concernant la physique, la biogéochimie, etc.) ou collectées à partir de bases de données (imagerie satellitaire, etc.), offrant un contexte riche pour les observations planctoniques. Sur différents sites, des structures spécifiques à mésoéchelle sont ciblées et/ou des gradients côte-large sont échantillonnés. L'objectif général du post-doctorat est de relier certains aspects de la communauté planctonique aux processus de forçage environnementaux dans un environnement côtier complexe et dynamique. Cela peut inclure la composition générale, mais aussi la trophodynamique, la distribution des tailles, le taux de parasitisme ou de symbiose, etc., tous accessibles à partir des images. L'orientation spécifique du travail est délibérément laissée ouverte pour permettre au candidat sélectionné de poursuivre une ligne de recherche qui l'intéresse le plus et qui correspond à ses objectifs de carrière.
Le poste est ouvert pour une durée de 2 ans (à ajuster en fonction de l'expérience et du salaire).


Activités :
- Assembler des jeux de données dans un format prêt pour l'analyse. Le candidat sera assisté dans cette tâche par le centre de données créé dans le cadre du projet et par un gestionnaire de données déjà recruté au sein du laboratoire.
- Définir une ou plusieurs questions de recherche précises et effectuer des analyses de données pour les explorer.
- Rédiger des articles scientifiques et faire des présentations scientifiques lors de conférences internationales.
- Participer aux réunions de projet ainsi qu'aux réunions de l'équipe et du laboratoire à Villefranche.

Contexte de travail :
Le Laboratoire d'Océanographie de Villefranche (LOV ; http://lov.obs-vlfr.fr/) est situé près de Nice, sur la Côte d'Azur, dans l'une des trois stations marines de Sorbonne Université. Avec environ 90 employés, le LOV génère et analyse une grande quantité de données marines, notamment des données d'imagerie, génomiques et satellitaires, pour étudier l'océan.

L'équipe COMPLEx (COMPutational PLAnkton Ecology) compte une quarantaine de membres qui étudient le plancton marin en collectant des données avec des instruments d'imagerie quantitative et de la génomique à haut débit, qui viennent alimenter des méthodes d'analyse numérique (modélisation, statistiques, apprentissage automatique). Le plancton englobe tous les organismes dérivant avec les courants marins. Ces organismes produisent une partie de l'oxyg
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