Chercheur Post-doctorat (H/F) en Biologie structurale

Missions :
Comprendre les mécanismes de modifications des ARN ribosomiques et de transfert de Vibrio cholerae et leurs rôles dans la tolérance aux antibiotiques

Un contrat post-doctoral de 2 ans est disponible dans le groupe "Biogenèse, architecture et interactions des ARN" dirigé par Carine Tisné à l'Institut de Biologie Physico-chimique (IBPC) au coeur de Paris. Le chercheur ou la chercheurse participera au projet ANR EpiRNA. Il/elle étudiera les mécanismes moléculaires de modifications post-transcriptionnelles des ARN (ARN ribosomiques et ARN de transfert) de Vibrio cholerae, agent responsable du choléra. L’équipe de Zeynep Baharoglu, avec qui nous collaborons, a montré que les modifications de ces ARN jouent un rôle central dans la réponse au stress antibiotique, en particulier celui causé par les aminoglycosides (tobramycine, gentamicine). Nous sommes en train d'établir le paysage des modifications des ARN de Vibrio cholerae, en associant les positions des modifications aux enzymes de modification. Nos résultats indiquent que E. coli et V. cholerae présentent des différences dans leurs schémas de modifications des ARN. Nos données identifient également des sites de modification précédemment non décrits. Il est donc important d'explorer davantage ces modifications chez V. cholerae et leur lien avec les réponses au stress antibiotique. D’après nos données préliminaires, la composition du ribosome et l’interaction avec les partenaires semblent être altérées en l'absence de certaines modifications de l'ARNr. De plus, plusieurs modifications des ARNt semblent moduler les niveaux d'autres modifications, conduisant ainsi à la tolérance aux antibiotiques. Nous proposons une approche interdisciplinaire combinant la génétique classique et la caractérisation phénotypique avec des études structurales (cryoEM) afin de (i) caractériser une nouvelle modification de l'ARNr effectuée par une méthyltransférase bactérienne nouvellement découverte et son impact sur la résistance aux antibiotiques ; (ii) comprendre comment la modulation des modifications des ARNr en réponse aux antibiotiques peut influencer l'assemblage/la stabilité, la structure et les partenaires du ribosome; et (iii) comment la présence ou l'absence d’une modification donnée d’un ARNt peut influencer les voies de maturation des ARNt chez V. cholerae, en particulier en présence d'antibiotiques. L'objectif ultime du projet est de faire progresser notre compréhension de la régulation médiée par les ARN, au moyen de reconstitutions biochimiques et de caractérisations structurales des complexes de maturation des ARN chez Vibrio cholerae.
Ce poste peut conduire à une candidature au concours national du CNRS pour un poste permanent.

PI: Carine TISNE, IBPC, UMR 8261; tisne@ibpc.fr

Publications liées au sujet :
1) V. Meynier, S. W. Hardwick, M. Catala, J. Roske, S. Oerum, D. Y. Chirgadze, P. Barraud, W. Yu, B. F. Luisi, C. Tisné. Structural basis
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