Chercheur postdoctoral (H/F) - comparative transcriptomics, developmental biology
Référence : UMR5554-ALESAD-001
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 34095 MONTPELLIER (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
- Nature du contrat Non renseigné
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) 2934.82 € - 4122.59 € € brut/an
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Missions :
Votre mission : rejoindre le nouveau projet ERC NOVELTEETH porté par Alexa SADIER à l'Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier (ISE-M) en tant que chercheur postdoctoral. Ce projet vise à comprendre l'origine et la diversification d'une innovation majeure chez les mammifères – les classes de dents – du génotype au phénotype à l'aide d'approches interdisciplinaires. Pour ce faire, vous travaillerez sur des données morphologiques et transcriptomiques chez l'adulte et au cours du développement sur plusieurs espèces de chauves-souris provenant de différentes niches écologiques. Vous utiliserez des approches innovantes à haut débit et étendrez finalement ces résultats à d'autres mammifères. Ce poste offre une opportunité unique de travailler à la fois sur des données morphologiques et transcriptomique au cours du développement en utilisant des techniques de pointe tant sur le terrain qu'en laboratoire.
Activités :
L'objectif principal est de déterminer précisément les signatures morphologiques et transcriptomiques de chaque classe de dents (incisives, canines, prémolaires et molaires) chez la chauve-souris afin de généraliser leur signatures chez les mammifères. Vous aurez également la possibilité de développer vos propres thématiques dans le cadre des recherches effectuées en laboratoire. Pour ce faire, vous devrez :
• Mettre en œuvre des techniques de transcriptomique spatiale chez les chauves-souris (dents en développement) – vous développerez la préparation des échantillons, la reconstruction et l'assemblage du transcriptome, l'interprétation des résultats à l'aide d'outils exclusifs des techniques utilisées 10x Visium, Xenium, Curio et/ou MERFISH.
• Établir des morphospaces au cours du développement en collaboration avec un doctorant – vous reconstruirez la signature morphologique de chaque classe de dents au cours du développement chez plusieurs espèces de chauves-souris à partir de μCT scans et développerez de nouvelles méthodes (landmark, morphométrie géométrique) pour comparer les morphospaces en développement aux données transcriptomiques. Vous travaillerez sur des μCT scans générés à l'ISE-M et/ou préalablement obtenus avec l'aide d'un technicien.
• La possibilité (selon la volonté du/de la candidat(e) de participer aux missions de terrain pour collecter des échantillons (Trinidad, République dominicaine) dans le cadre d'expédition de terrain intensives exigeant de longues heures de travail de nuit dans des endroits isolés.
• Collaborer avec un réseau international de collaborateurs
• Communiquer vos résultats – vous partagererez vos résultats par le biais de publications, de présentations lors de conférences internationales et de rapports.
Contexte de travail :
Le/la candidat(e) rejoindra le groupe NOVELTEETH porté par le Dr. A. Sadier (CNRS) au sein de l'équipe Macroevolution et Développement (https://isem-evolution.fr/equipe/equipe-macroevolution-et-devel
Voir plus sur le site emploi.cnrs.fr...
Profil recherché
Competences :
• Expertise en analyse bioinformatique de données transcriptomiques : cartographie du génome, assemblage
• Expertise en analyse statistique de données transcriptomiques : analyses comparatives de stades de développement et comparaison interspécifique dans un cadre phylogénétique contraint
• Expérience en biologie moléculaire : séquençage, transcription
• Expertise des pipelines d'analyse de données transcriptomiques
• Expertise en biologie évolutive : phylogénie, régulation des gènes
• Maîtrise des langages R ou python
• Revue de la littérature sur les méthodes applicables
• Très bon niveau d'anglais oral et écrit
• La pratique d'une activité d'extérieur/outdoor (randonnée, escalade, spéléologie) sera un bonus
• Des connaissances en morphométrie (segmentation sur scans, landmarking, morphométrie géométrique) sera un plus
Les candidats devront être titulaires d'un doctorat ou d'un équivalent dans une discipline connexe (biologie évolutive ou bioinformatique), avec une forte expérience en analyse statistique sous R ou python et en pipelines d'analyse de données transcriptomiques.
Contraintes et risques :
Risques associés au travail classique en laboratoire. Risques particulier : travail de terrain exigeant en milieu hostile (jungle, zone tropical) impliquant la manipulation d'animaux (chauves-souris). Ce travail implique du travail de nuit en horaire décalé impactant le sommeil durant les missions de terrain.
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
- Spécialisation Formations générales
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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Le contrat est 12 mois renouvelable jusqu'à 3 fois. Les candidats souhaitant s'investir dans le projet pour une longue durée seront préférés.
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Chercheuse / Chercheur
