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Chercheur postdoctorant H/F: Mécanisme de l'encapsidation du génome viral et de transduction d'ADN bact

Référence : UMR9198-PAUDER-005

  • Fonction publique : Fonction publique de l'État
  • Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
  • Localisation : 91198 GIF SUR YVETTE (France)
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  • Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
  • Nature du contrat Non renseigné
  • Expérience souhaitée Non renseigné
  • Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) salaire brut mensuel entre 3081€ et 3519€ selon expérience € brut/an
  • Catégorie Catégorie A (cadre)
  • Management Non renseigné
  • Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

Missions :
Le chercheur étudiera les mécanismes employés par les virus bactériens (bactériophages ou phages) pour encapsider sélectivement leur ADN dans la procapside virale et les bases moléculaires des erreurs dans ce processus conduisant à l'encapsidation d'ADN bactérien (transduction). Ces erreurs constituent une source majeure de transfert horizontal de gènes qui est responsable d’une dissémination rapide de la résistance aux antibiotiques, de facteurs de pathogénicité et d’autres éléments génétiques au sein des communautés bactériennes.

Les recherches seront conduites avec le bactériophage SPP1 qui infecte la bactérie Gram-positive Bacillus subtilis. Le projet s'appuie sur une connaissance approfondie du processus d’encapsidation du génome de SPP1 (Nucleic Acids Res 41, 340-354; J. Mol. Biol. 429, 1381-1395; Nat. Commun. 10, 4840; PNAS 118, e2018297118; Nat Commun. 13, 7283) et sur la découverte que ce phage peut évoluer rapidement pour devenir un vecteur très efficace de transfert d’ADN bactérien.
Activités :
- Conduire des expériences de biologie moléculaire (clonage, construction de virus recombinants, ChiP-Seq, analyse de données NGS, transcriptomique bactérienne) et microbiologie (infection phagique, transduction, imagerie de bactéries infectées) en fonction des besoins du projet. Des travaux de biochimie (purification et caractérisation de protéines en système procaryote, caractérisation de complexes protéine-ADN in vivo et in vitro) pourront être aussi envisagés.

- Maintenir un registre des travaux et des données de recherche suivant la réglementation de l’Institut et de l’ANR. Mettre en forme les résultats et communiquer les données expérimentales. Rédaction et présentation des résultats de recherche en anglais.

- Assurer une veille scientifique et technologique sur la thématique de recherche.
Contexte de travail :
L'équipe d'accueil "Bactériophages de bactéries Gram-positives" étudie l'assemblage des bactériophages caudés et l'infection des bactéries Gram-positives par ces virus ("https://www.i2bc.paris-saclay.fr/bacteriophages-of-gram-positive-bacteria/").

Elle est associée au Département de Virologie de L'Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC) (https://www.i2bc.paris-saclay.fr/). Celui-ci offre un environnement pluridisciplinaire pour la recherche en biologie moléculaire et cellulaire dans le campus CNRS de Gif-sur-Yvette (Paris-Saclay, Ile de France). L'I2BC est constitué de 60 équipes dont les recherches sont soutenues par des plateformes technologiques de pointe de NGS, bioinformatique, protéomique, microscopies, biophysique et biologie structurale parmi d'autres (https://www.i2bc.paris-saclay.fr/facilities/).

Profil recherché

Competences :
- un doctorat en biologie moléculaire, microbiologie, biochimie bactérienne, ou en génétique des bactériophages/bactéries est bien adapté pour ce projet
- expérience en biologie moléculaire, bactériologie ou biochimie
- Savoir formuler et tester des hypothèses de manière expérimentale
- Suivi de la littérature scientifique et méthodologique du domaine
- capacité de travail en équipe et en collaboration
- connaissance d'anglais oral et écrit (niveau C2)
Contraintes et risques :
- travail en laboratoire L1
- Possibilité de missions courtes en France et à l’étranger

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
  • Spécialisation Formations générales

Langues

  • Français Seuil

Qui sommes-nous ?

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.

C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.

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À propos de l'offre

  • Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

  • Vacant
  • Chercheuse / Chercheur

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