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Contrat doctoral H/F - Modèle pronostique de la maladie de Parkinson par apprentissage profond combinan

Référence : UMR5220-CARLAR-004

  • Fonction publique : Fonction publique de l'État
  • Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
  • Localisation : 69621 VILLEURBANNE (France)
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  • Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
  • Nature du contrat Non renseigné
  • Expérience souhaitée Non renseigné
  • Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels La rémunération est d'un minimum de 2200,00 € mensuel € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
  • Catégorie Catégorie A (cadre)
  • Management Non renseigné
  • Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

Sujet de thèse :
Ce projet de recherche vise à développer un modèle diagnostic innovant pour la détection précoce de la maladie de Parkinson (MP) en intégrant des données d'imagerie multimodales (IRM et TEP) avec des informations cliniques. Notre hypothèse est que la combinaison de ces données permettra d'identifier les patients à des stades précoces de la maladie, en utilisant des techniques d'intelligence artificielle (IA) avancées.

L'objectif principal est de concevoir un modèle prédictif capable de discriminer les sous-types de patients au stade prodromal ou peu avancé de la MP, robuste et généralisable dans un contexte de faible régime de donnée, et explicable. L'explicabilité est cruciale pour garantir l'adhésion des cliniciens et pour analyser l'impact des biomarqueurs sur les mécanismes physiopathologiques de la MP.

Le projet se distingue par son ambition d'explorer des données complexes et multimodales, en particulier d’évaluer l’implication du système noradrénergique (NA) qui précède celle du système dopaminergique (DA) bien avant l'apparition des premiers symptômes de la MP. Cette étude originale est possible grâce aux travaux précurseurs de l’équipe de B Ballanger, co-directrice de thèse, basés en particulier sur l’imagerie d’un nouveau radiotraceur TEP du système NA, 11C-Yohimbine. En plus de développer un modèle prédictif, l'équipe souhaite extraire les marqueurs d'intérêt pour mieux comprendre les dérèglements des systèmes NA et DA durant la phase prodromale.

D’un point de vue méthodologique, cette thèse vise à proposer des contributions méthodologiques originales dans le domaine de modèles prédictifs explicables par apprentissage sur des données hétérogènes Ces modèles pourront s’appuyer sur des modèles de détection d’anomalies subtiles qui pourront également faire l’objet de contributions méthodologiques.

D’un point de vue applicatif, le formalisme développé permettra de détecter des patients atteints de la maladie de Parkinson à des stades précoces ou prodromaux, et extraire des marqueurs d’imagerie et clinique de cette pathologie, permettant ainsi de mieux comprendre ses mécanismes physiopathologiques, et in fine, de développer des thérapies plus performantes.

Ce projet représente une avancée significative vers un diagnostic précoce et des traitements personnalisés pour la MP.

Une description plus détaillée du sujet est disponible ici :
https://www.creatis.insa-lyon.fr/site/fr/PrediPark_Thesis

Contexte :
Le projet de thèse s’inscrit dans le cadre du projet PREDIPARK permettant de modéliser des données complexes pour détecter et prédire l’évolution de patients à des stades précoces de la maladie de Parkinson. Ce projet interdisciplinaire est financé dans le cadre de l’appel à contrats doctoraux « Feuille de route santé » piloté par la Mission pour les Initiatives Transverses et Interdisciplinaires (MITI) du CNRS.

La thèse se déroulera sur le campus scientifique LyonT
Voir plus sur le site emploi.cnrs.fr...

Profil recherché

Contraintes et risques :
Nous sommes à la recherche d’un candidat (H/F) disposant d’un solide dossier académique en Mathématiques Appliquées, Informatique, ou analyse d’images, motivé et autonome avec un fort intérêt dans la recherche pluridisciplinaire (Apprentissage statistique et traitement d’image dans un contexte médical). Une bonne connaissance des librairies de machine learning (TensorFlow, Pytorch, Scikit learn) est requise, une expérience avec les systèmes d’exploitation sous noyau Linux et la modélisation de données d’imagerie biomédicale sera appréciée.

Compétences / Qualifications.
• Master ou équivalent en Mathématiques Appliquées, Informatique, ou Traitement du Signal et des Images
• Bonnes compétences en Informatique
• Motivation et aptitude à s’investir dans un travail interdisciplinaire et collaboratif.
• Bonnes capacités organisationnelles, autonomie
• Volonté de participer à des séminaires, ateliers et réunions scientifiques.

Une présélection sera réalisée sur la base du CV, de l’expérience, des compétences et de la lettre de motivation. Les candidats présélectionnés seront convoqués pour une audition.

Les candidatures doivent comprendre les documents suivants :
- Un Curriculum Vitae complet
- Une lettre de motivation, exposant les intérêts de recherche du candidat en lien avec le projet
- Les relevés de notes de Master (M1 et M2) ou équivalent, ainsi que tout certificat pertinent
- Le contact d'une ou deux personnes référentes
- Si possible, une ou deux lettres de recommandation


Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
  • Spécialisation Formations générales

Langues

  • Français Seuil

Qui sommes-nous ?

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.

C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.

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  • Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

  • Vacant
  • Chercheuse / Chercheur

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