Doctorant en biologie moléculaire et génétique (H/F)

Sujet de thèse :
Ce projet de doctorat vise à comprendre le mécanisme moléculaire de l’élimination programmée de l’ADN (PDE), dirigée par les petits ARN, chez le cilié Tetrahymena. De nombreux acteurs impliqués dans la PDE (appelés facteurs de la PDE) restent non identifiés, probablement parce que les études précédentes ont principalement utilisé soit une approche de génétique inverse basée sur des candidats par inactivation génique (KO), dans laquelle seul un nombre limité de gènes a été examiné et les gènes essentiels à la croissance végétative n’ont pas pu être testés pour leurs fonctions dans la PDE, soit la co-précipitation avec des facteurs de PDE déjà connus, méthode qui ne permet pas de détecter les interacteurs transitoires et/ou instables. Pour surmonter ces limitations, ce projet vise à : a) optimiser la méthode d’inactivation génique (KD) basée sur Cas13 chez Tetrahymena ; b) établir des méthodes de tri permettant d’isoler les cellules ou noyaux présentant des défauts dans diverses étapes de la PDE ; c) réaliser un criblage génétique à grande échelle en combinant (a) et (b) afin d’identifier les facteurs de la PDE ; d) utiliser le système LOV-Turbo-ID pour identifier les facteurs de la PDE ; et e) caractériser les nouveaux facteurs de la PDE ainsi identifiés.
Contexte :
L’institut de génétique humaine (IGH) est une unité mixte de recherche (CNRS université). L’unité a un effectif de 220 personnes et est divisée en trois déparetments. L'étudiant ou étudiante évoluera au sein de l’équipe ‘Epigenetic Chromatin Regulation’ sous la supervision du Dr K. Mochizuki (DR1, CNRS). L'IGH est situé sur le campus Arnaud de Villeneuve, partie prenante du programme Objectif Employeur Pro-Vélo.