Doctorant (H/F) en Chimie Moléculaire

Sujet de thèse :
Synthèse bio-inspirée de conjugués C-saccharidiques antiparasitaires par ingénierie moléculaire de glycosidases
Contexte et objectifs : Le galactofuranose (Galf) est l'un des hexofuranoses les plus abondants identifiés à ce jour. Il est en particulier présent dans le glycocalyx de certains micro-organismes, souvent pathogènes comme ceux des genres Leishmania, Trypanosoma ou Mycobacteria1,2. Comme le squelette du Galf est complètement xénobiotique chez les mammifères, il constitue une cible intéressante en tant que nouveau pharmacophore. Ainsi, différentes familles de dérivés O- et S-galactofuranosides d’alkyle ont montré de bonnes inhibitions de la croissance de souches de mycobacteries ou de leishmanies avec des concentrations minimales inhibitrices de l’ordre du micromolaire3,4. Cependant, l’utilisation de tels glycosides est limitée par leur forte sensibilité à l’hydrolyse. Le passage d’une liaison O-glycosidique à une liaison C-glycosidique permet de limiter cette hydrolyse et nous avons déjà pu montrer que des composés de type C-galactofuranosides d’alkyle possédaient des activités antimycobactériennes et antileishmaniennes supérieures à leurs analogues O-glycosidiques.5 L’accès à de telles molécules implique cependant la mise en œuvre d’une cascade réactionnelle complexe, l’utilisation de catalyseurs toxiques et de solvants. Des alternatives plus respectueuses de l’environnement existent mais restent limitées aux pyranosides. Aucune synthèse sélective, efficace et écologique de conjugués C-furanosidiques potentiellement bioactifs n’existe à ce jour.
Dans ce contexte, ce projet de thèse ambitionne de développer une alternative plus respectueuse de l’environnement basée sur des réactions chimio-enzymatiques se déroulant dans des conditions douces en milieu aqueux. Récemment, notre équipe a pu montrer que l’activité de glycosidases pouvait être modifiée afin d’obtenir sélectivement des O- et des S-furanosides d’aryle mais pas des analogues C-glycosidiques.6 L’objectif du projet de thèse est ainsi de franchir une étape supplémentaire par création de novo d’une réactivité enzymatique inédite, à savoir la C-glycoligation. En particulier, il s’agira de remodeler la poche catalytique d’une glycosidase afin d’obtenir des C-furanosides d’aryles par activation sélective de phénols. Grâce à ces approches innovantes, complémentaires et éco-compatibles, nous visons à obtenir rapidement une large gamme d’analogues, à les évaluer contre plusieurs microorganismes et à contribuer ainsi au développement de nouveaux antiparasitaires.
Méthodologie : Dans le cadre de ce projet, le.la doctorant.e aura pour tâche la production et la purification d’enzymes mutées à l’aide des outils de la biologie moléculaire maitrisés dans l’équipe d’accueil. Il.Elle criblera ensuite les meilleurs mutants et les meilleures conditions pour réaliser une C-glycoligation sur un substrat modèle avant d’étendre la strat
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