Doctorant(e) en éléments finis pour la morphogenèse cellulaire H/F
Référence : UMR7241-HERTUR-015
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 75231 PARIS 05 (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
- Nature du contrat Non renseigné
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels La rémunération est d'un minimum de 2200,00 € brut mensuel € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Sujet de thèse :
Sujet: Modélisation par éléments finis des mécanismes physico-chimiques à l’origine des divisions cellulaires asymétriques chez les spiraliens
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Contexte scientifique:
Chez de nombreux invertébrés marins, le développement embryonnaire débute par des divisions cellulaires spiralées, un mode de clivage ancestral. Dans plusieurs lignées, l’évolution a conduit à l’apparition indépendante de divisions cellulaires asymétriques via la formation d’une structure corticale singulière appelée lobule polaire (polar lobe, PL), un renflement cytoplasmique transitoire. Cette structure joue un rôle crucial dans la ségrégation des déterminants du destin cellulaire, influençant profondément le développement embryonnaire.
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Objectifs scientifiques:
La thèse visera à développer une plateforme numérique avancée de modélisation par éléments finis pour simuler les mécanismes mécano-chimiques en jeu lors de la formation des lobules polaires. L’objectif est d’articuler deux aspects principaux :
1. WP5 – Modélisation mécano-chimique du cortex cellulaire :
Élaborer un modèle tridimensionnel couplant la dynamique biochimique des GTPases (Rho, Rac) à la mécanique active du cortex cellulaire. Ce modèle devra intégrer les flux de matière, la contractilité et les phénomènes de bifurcation spatiale donnant lieu à des domaines de faible tension responsables de l’extrusion du lobule polaire.
2. WP6 – Modélisation des flux cytoplasmiques et de la ségrégation des déterminants du destin cellulaire:
Étendre le modèle précédent en couplant dynamiquement la surface corticale avec le fluide cytoplasmique environnant. À l’aide de méthodes d’éléments finis non ajustés (unfitted FEM), il s’agira de prédire l’impact des flux cytoplasmiques sur la répartition spatiale de particules solides représentant des déterminants du destin cellulaire.
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Méthodologie:
• Développement de modèles en 3D basés sur des équations aux dérivées partielles (EDP) non linéaires couplant advection, diffusion, réaction chimique et mécanique de membrane.
• Implémentation numérique via la méthode des éléments finis sur surface implicite (trace-FEM et aggregated FEM).
• Calibrage des modèles par des données expérimentales provenant des WP3–4 (mesures de tension corticale, microscopie à feuillet lumineux, suivi des marqueurs moléculaires).
• Comparaison systématique des simulations avec les espèces spiraliens étudiées expérimentalement (ex. Ilyanassa, Chaetopterus).
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Profil recherché:
Le/la candidat·e devra avoir une solide formation en physique ou en mathématiques appliquées, avec un intérêt marqué pour la biologie cellulaire. Des compétences en :
• modélisation physique (mécanique des milieux continus, dynamique des fluides),
• éléments finis ou méthodes numériques similaires,
• programmation scientifique (Python, C++, Julia, FEniCS, FreeFem, GridAp ou équivalent),
seront fortement valorisées. Une sensibilité à l’interdisciplinarité et à la c
Voir plus sur le site emploi.cnrs.fr...
Profil recherché
Contraintes et risques :
Travail à temps plein.
Pas de risque particulier identifié.
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents
- Spécialisation Formations générales
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Chercheuse / Chercheur
