H/F Ingénieur de Recherche analyses à haut débit de la diversité microbienne marine

Référence : UMR8187-LUIART-007

  • Fonction publique : Fonction publique de l'État
  • Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
  • Localisation : 62930 WIMEREUX (France)
Domaine : Recherche
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  • Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
  • Nature du contrat Non renseigné
  • Expérience souhaitée Non renseigné
  • Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels 3175 € bruts mensuels € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
  • Catégorie Catégorie A (cadre)
  • Management Non renseigné
  • Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

Missions :
L’ingénieur de recherche, spécialisé en approches biologie et analyses de laboratoire aura comme missions d’assurer des mesures à haut débit de la biodiversté pélagique microbienne marine en Manche Orientale et Mer du Nord dans le cadre, incluant le travail de terrain, de laboratoire, traitement des données brutes et analyse de données en vue de leur rapportage et publication,
Activités :
- Développer des protocoles standardisés pour l’utilisation en routine des instruments de pointes mise en place au sein des plateformes technologiques dont celles acquises sur les grands projets structurant comme le CPER IDEAL (Next-Generation Sequencing, Expérimentale et Observation, Géomatique et Télédétection)
- Apporter un soutien technique et théorique sur les aspects de biologie moléculaire et biologie cellulaire nécessaires à la bonne réalisation expérimentale d'un projet scientifique
- Conseiller et apporter des solutions techniques pour permettre de lever les verrous méthodologiques en analyses moléculaires de diversité taxonomique, fonctionnelle et activités microbiennes.
- Analyser les échantillons (extraction d’acides nucléiques, clonage/séquençage, préparation de librairie d’ADN, séquençage, analyses automatisées…) dans le cadre des projets scientifiques, de suivi des écosystèmes et/ou de prestations de service
- Mettre en place et utiliser des outils bio-informatiques pour l’analyser, l’interprétation et la validation des résultats
- Assurer une veille scientifique pour faire évoluer les pratiques et les protocoles selon les dernières normes et développements technologiques
- Participer ponctuellement à des campagnes de terrain (prélèvements et mesures in situ...)
- Gérer le planning d’utilisation des appareils et veiller à l’application des règles d'hygiène et de sécurité
- Diffuser et valoriser les résultats et réalisations technologiques via des publications, des protocoles et des rapports techniques
- Former, en interne et en externe, aux technologies de pointe (notamment en microbiologie, biologie moléculaire, séquençage à haut débit) et encadrer les utilisateurs
Contexte de travail :
Les activités de l'ingénieur s'exerceront au sein de l’équipe Ecologie Pélagique Planctonique du Laboratoire d’Océanologie et Géosciences (CNRS UMR 8187 LOG - ULCO - U Lille), sous la responsabilité du responsable d’équipe et coordinateur LOG du partenariat CNRS du projet européen Horizons OBAMA NEXT, du partenariat ULCO du projet PPR Océan et Climat FutureOBS et co-responsable du plateau « Observation, Géomatique et Télédédétection » du projet CPER IDEAL. Le travail se fera en collaboration avec les membres de l’équipe et de chercheurs des laboratoires partenaires des projets cités.
L'Ingénieur aura pour mission principale de réaliser les analyses d’échantillons collectés au cours des campagnes en mer CARPARC et RiOMar Seine MO-1 et -2 (2024), IBTS et CGFS (de plusieurs années).
Il(elle) devra
Voir plus sur le site emploi.cnrs.fr...

Profil recherché

Competences :
- Connaissance des méthodologies de séquençage classique et à haut débit (préparation de librairie, métabarcoding, métagénomique, transcriptomique, séquenceur Oxford Nanopore Minion...)
- Connaissance théorique et pratique d’une ou plusieurs approches méthodologiques appliquées à la microbiologie
- Bioinformatique : connaissance appliquée dans l’analyse des données de séquençage à haut débit et techniques analytiques d’observation et d’identification des espèces
- Langue anglaise courante
- Concevoir, adapter et mettre en œuvre les dispositifs expérimentaux adaptés aux contraintes de la recherche en biologie cellulaire, microbiologie et biologie moléculaire
- Développer, par la veille et l’expérimentation, sa propre expertise scientifique et technologique dans son domaine
- Utiliser les logiciels bioinformatiques spécifiques à l’activité
- Rédiger les publications et rapport scientifiques s’appuyant sur la bibliographie, les matériels utilisés et les méthodes mises en œuvre
- Capacité de raisonnement analytique
- Sens de l’organisation
- Sens relationnel
Contraintes et risques :
Travail de laboratoire. Travail au bureau avec utilisation différents outils informatiques. Déplacements éventuels en France et à l'étranger pour des réunions de travail et présentation dans des congrès internationaux.

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
  • Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)

Langues

  • Français Seuil

Qui sommes-nous ?

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.

C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.

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À propos de l'offre

  • Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

  • Vacant

  • Experte / Expert en expérimentation, instrumentation et techniques biologiques

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