(H/F) Ingénieur de recherche en apprentissage par renforcement pour l'embryogenèse
Référence : UMR5077-MARPEL1-019
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 31062 TOULOUSE (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
- Nature du contrat Non renseigné
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels Entre 3143.64 € et 3403.43 € brut mensuel selon l'expérience € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Missions :
Le ou la candidat·e retenu·e développera un cadre computationnel pour étudier l’émergence d’information durant l’embryogenèse, en combinant théorie de l’information, mesures de complexité et apprentissage par renforcement multi-agents afin de révéler et quantifier la complexité morphogénétique fonctionnelle
Activités :
• Concevoir et implémenter des métriques d’information et de complexité appliquées à des données embryonnaires 3D+temps (ex. information mutuelle, information positionnelle/corrélationnelle, complexité algorithmique, métriques topologiques / invariants).
• Développer une approche d'apprentissage par renforcement multi-agent où les cellules sont modélisées comme des agents apprenant des politiques d’action sous contraintes mécaniques/biophysiques, avec définition de signaux de récompense (structure finale, robustesse, contraintes topologiques, etc.).
• Construire et maintenir une chaîne de calcul reproductible (pipelines de données, entraînements, évaluation, gestion d’expériences), et contribuer à la diffusion logicielle (documentation, dépôt, bonnes pratiques).
• Interagir étroitement avec les biologistes/biophysicien·nes et les autres profils computationnels de l’équipe, participer à la rédaction d’articles, présentations et à la vie scientifique de l’unité.
Contexte de travail :
Le ou la candidat·e retenu·e rejoindra l’équipe interdisciplinaire Multiscale Physics of Morphogenesis, dirigée par Hervé Turlier et composée d’une demi-douzaine de chercheurs.
L’équipe s’engage à offrir un environnement de travail bienveillant, inclusif et diversifié.
Elle sera située à partir du 1er mars au Centre de Biologie Intégrative sur le campus Paul Sabatier de l'Université de Toulouse, dans un environnement scientifique idéal pour développer les interfaces entre biologie, modélisation physique et numérique et apprentissage machine.
Le ou la candidat·e disposera d’un poste de travail individuel dans des locaux rénovés, d’un ordinateur portable performant et d’un accès à un cluster de calcul haute performance dédié à l’équipe (12 GPU, 396 CPU).
Le poste ne présente aucune contrainte ou risque particulier et un jour de télétravail par semaine est possible.
Profil recherché
Competences :
Compétences indispensables :
• Très bon niveau en programmation scientifique (Python) et environnement data/IA (NumPy/SciPy, PyTorch ou JAX, gestion d’expériences).
• Solides bases en apprentissage automatique, idéalement RL (policy gradients/actor-critic, exploration, reward shaping).
• Maîtrise des outils de dev/reproductibilité : Git, tests, packaging, environnements (conda/poetry), conteneurs (Docker/Singularity), scripts HPC.
• Capacité à conduire un travail de recherche : lecture critique, prototypage, validation, documentation, transfert aux collègues.
Compétences appréciées :
• Connaissances en théorie de l’information, statistiques, inférence.
• Notions en biophysique / mécanique des tissus ou intérêt fort pour la modélisation du vivant.
• Expérience avec données spatio-temporelles 3D, graphes dynamiques, ou analyse topologique (selon l’orientation choisie).
Savoir-être :
• Goût pour le travail interdisciplinaire (biologie–physique–informatique), autonomie, rigueur, sens du partage (code, méthodes), communication scientifique (écrit/oral).
Contraintes et risques :
Télétravail possible 1j/semaine
Contrat de 6 mois, avec possibilité de doctorat au 1er septembre 2026.
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents
- Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Experte / Expert en expérimentation, instrumentation et techniques biologiques
