Ingénieur Bioinformatique / Datamanagement F/H

Référence : APHP_2025-17729

  • Fonction publique : Fonction publique Hospitalière
  • Employeur : Siège de l'AP-HP
  • Localisation : Paris (75), France

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  • Nature de l’emploi Emploi ouvert aux titulaires et aux contractuels
  • Expérience souhaitée Non renseigné
  • Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels Non renseignée Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
  • Catégorie Non renseigné
  • Management Non renseigné
  • Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

Au sein du pôle Innovation et Données de la DSN de l'AP-HP, la plateforme de bioinformatique MOABI a pour missions :
- La centralisation progressive du stockage des données de génomique produites au niveau de 39 hôpitaux
- Leur analyse dans le cadre de processus maitrisés et normalisés
- La mise à disposition d’outils d’exploitation des résultats
- L’animation d'une communauté bioinformatique de l’AP-HP regroupant plusieurs dizaines d'ingénieurs
- Le support technique et scientifique, la formation
- La veille technologique en bioinformatique
La stratégie mise en place à MOABI pour le développement de pipelines d’analyses permet de garantir un niveau de standardisation, de traçabilité et de reproductibilité de qualité industrielle.

Afin de renforcer ses activités bioinformatiques, la plateforme MOABI recherche un.e ingénieur.e en bioinformatique, dont les missions principales seront les suivantes :
- Mettre en place des solutions d’analyse de données pour les cytogénéticiens de l’AP-HP
- Développer une base de données de variants structuraux (SV) à l’échelle de l’AP-HP
- Mettre en place et suivre le cycle de vie des données de génétiques

Profil recherché

Idéalement, vous avez …
- Ingénieur(e) A+ et/ou PhD et/ou MD (Bioinformatique, Mathématiques, Biostatistique, Informatique)

Vous maîtrisez :
- Excellente connaissance d’un langage de script (Python, Bash)
- Excellente connaissance de R
- Excellente connaissance en gestion de données (data management)
- Expérience en analyses de données cytogénétiques
- Maîtrise de l'environnement Linux/Unix

Et humainement ? vous êtes …
- Excellentes qualités relationnelles et organisationnelles
- Excellent esprit d'équipe et sens relationnel
- Excellentes qualités de communication
- Autonomie, rigueur, méthode
- Capacité de travail très importante, associée à un fort dynamisme.
- Curiosité et capacité d’adaptation et d’anticipation
- Fort intérêt pour le domaine des sciences biologiques et/ou médicales.
- Adhésion aux valeurs du service public et intérêt prononcé pour le domaine de la santé
- Adhésion aux valeurs de partage de connaissances et de compétences

À propos de l'offre

  • Cheffe / Chef de projet maitrise d'œuvre SI

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