Ingénieur d'étude (H/F) : metabarcoding - développement multiplex et application matrice cérumen
Référence : UMR5300-PATBAL-002
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 31062 TOULOUSE (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
- Nature du contrat Non renseigné
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels 2496€ et 3215 € bruts mensuels selon expérience € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Missions :
Le candidat ou la candidate prendra part au projet EARSCAPE dont le but est d’identifier les pressions environnementales modelant la sensibilité auditive chez l'homme. Dans le cadre de ce poste, le candidat travaillera sur la caractérisation du microbiome de l'oreille, par analyse microbienne du cérumen.
Il/elle travaillera à l'optimisation d'un multiplex métabarcoding afin d’identifier la composante bactérienne, fongique et les traces de plantes présentent dans cette matrice. Pour cela, il/elle réalisera une partie expérimentale qui comprendra le développement et l’optimisation d'une PCR triplex, préparation de librairies, extraction des ADNs à partir du cérumen et analyse post-séquençage. Il/elle travaillera sur la plateforme de la B2M (Biologie moléculaire) du laboratoire.
Activités :
- Extraction ADN à partir de cerumen et quantification ADN (Nanodrop et Qubit)
- Développement et optimisation d’une PCR triplex metabarcoding
- Préparation de librairies
- Quantification ADNs
- Analyse données metabarcoding
- Présentation des résultats lors des réunions hebdomadaires
Contexte de travail :
Le CRBE Centre de Recherche sur la Biodiversité et l’environnement, est une unité mixte de recherche (UMR5300) dont les thématiques scientifiques s’articulent autour de l’influence des changements environnementaux et de leurs interactions avec la terre vivante, et les rétroactions des systèmes socio-écologiques sur ces changements. Le/la candidat. e travaillera dans le cadre d’un projet ANR EARSCAPE sur l’évolution de la sensibilité auditive humaine en rapport avec l’environnement. Il/elle interagira avec le Dr Patricia Balaresque et le Dr Nicolas Brucato et le personnel de la plateforme technique de la B2M.
Profil recherché
Competences :
- Compétences en biologie moléculaire (extraction ADNs, PCR, optimisation)
- Compétences en barcoding, metabarcoding et/ou métagénomique (préparation librairies)
- Rédaction de protocole sur la base de bibliographie existante
- Sérieux et application
- Synthèse de résultats et présentation
- Travail en équipe, autonomie
- Maitrise des outils bio-informatiques pour l'analyse des données de séquençage (souhaitable)
Contraintes et risques :
⁃ Travail sur échantillons humaines (cérumen, potentiellement salive) : port de gant, blouse obligatoire
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents
- Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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Le ou la candidate devra être titulaire d'un master en génomique et/ou biologie évolutive (compétence en metabarcoding ou métagénomique indispensables)
La personne recrutée interagira et collaborera avec les personnes impliquées dans le projet (CRBE).
Le contrat est d'une durée de 6 mois et débutera idéalement en Septembre 2025
Les personnes intéressées déposeront leur candidature (CV et lettre de motivation) sur l'espace candidature du Portail Emploi du CNRS (https://emploi.cnrs.fr/) -
Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Experte / Expert en expérimentation, instrumentation et techniques biologiques
