Ingénieur d'études - Métagénomique clinique
Référence : 2025-2019489
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : ENVT
- Localisation : 23 Chemin des Capelles - 31300 TOULOUSE
Partager la page
Veuillez pour partager sur Facebook, Twitter et LinkedIn.
- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
-
Nature du contrat
CDD de 2 ans
- Expérience souhaitée Non renseigné
-
Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels entre 25200 et 34920 € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Mission 1 : virologie clinique (diagnostic et recherche) : biologie moléculaire
· Réceptionner, enregistrer et stocker les échantillons selon un protocole de qualité défini, Tenir un cahier d’expériences, rassembler les résultats, les mettre en forme et en rendre compte.
· Réaliser, à partir de protocoles définis, des expériences de préparation et d’analyse utilisant un ensemble de techniques, notamment en biologie moléculaire (PCR conventionnelle, PCR temps réel, PCR digitale).
· Actualiser le dossier de protocoles techniques.
Missions 2 : métagénomique clinique
· Participer à la mise au point et mettre en œuvre les méthodes spécifiques de préparation des acides nucléiques en vue du séquençage NGS (technologie Oxford Nanopore notamment)
· Préparer des banques de séquençage NGS, lancement des essais (« runs ») de séquençage.
· Prise en charge des données de séquençage NGS : sauvegarde, contrôle qualité.
Mission 3 : missions transversales d’appui à l’activité du laboratoire de virologie clinique
· Contribuer à la surveillance des équipements scientifiques, la maintenance de premier niveau et l’entretien du laboratoire
· Se former à la mise en œuvre des nouvelles techniques dans le service et initier/accompagner les utilisateurs
· Appliquer, en situation de travail, les bonnes pratiques de laboratoire, les règles d’hygiène et de sécurité et celles spécifiques à la manipulation de certains produits
· Participer à la gestion des stocks et des commandes
Profil recherché
Savoirs :
• Connaitre les techniques de biologie moléculaire de base
• Bonnes pratiques de laboratoire
• Savoir appréhender les risques chimiques et biologiques liés aux produits, matériels et techniques utilisées.
• Savoir utiliser les logiciels liés aux techniques expérimentales et à la présentation des résultats.
• Comprendre une documentation en anglais
• Connaissance des techniques de NGS et de métagénomique.
• Connaissances de base du langage Linux.
Savoir-faire :
• Organiser et conduire son activité avec rigueur, autonomie et fiabilité
• Savoir manipuler dans des conditions stériles et travailler en milieu confiné
• Savoir utiliser les équipements de base d’un laboratoire (thermocycleur, microscope, centrifugeuse, spectrophotomètre, balance, …)
• Communiquer et collaborer avec les autres parties prenantes d’un projet.
• Savoir rendre compte, travailler en équipe
• Savoir transférer ses connaissances pour l’accompagnement à l’utilisation d’outils
• Savoir préparer des banques de séquençage NGS
• Savoir lancer un script de bioinformatique
Une expérience préalable en métagénomique est requise.
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents
Localisation
Éléments de candidature
Documents à transmettre
Qui sommes-nous ?
L'Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT) est un établissement public d'enseignement supérieur et de recherche sous tutelle du Ministère de l'Agriculture et de la Souveraineté Alimentaire. Elle forme plus de 900 élèves répartis en six promotions en formation initiale et des internes en clinique animale, et compte environ 350 personnels enseignants-chercheurs, administratifs et techniques et agents contractuels.
L'Etablissement a pour mission première la formation des vétérinaires (environ 160 diplômés par an) dans le cadre d'un référentiel de formation national qu'il se doit de respecter. L'Ecole est accréditée par l'Association Européenne des Etablissements d'Enseignement Vétérinaire (AEEEV) et donc soumise au respect des normes de cette association. En matière de recherche, l'Etablissement accueille plusieurs équipes de scientifiques : la plupart sont des UMR avec une cotutelle INRAE, INSERM, …) en lien avec la santé animale et la santé publique.
Descriptif du service
La demande de poste d’ingénieur(e) d’études s’inscrit dans le contexte du développement et de la structuration des projets de recherche en métagénomique virale :
Cette activité couvre un large champ technique : prise en charge d’échantillons cliniques, analyses de biologie moléculaire, préparation des banques d’ADN et lancement des runs de séquençage, prise en charge/QC des données de séquençage.
Dans ce contexte, les objectifs du poste consistent, au sein de l’équipe VIRAL de l’UMR IHAP, à prendre en charge des essais de diagnostic et de recherche en métagénomique virale.
À propos de l'offre
-
Droit à Congés : 50 jours (25 jours de droit commun et 25 jours RTT)
Base hebdomadaire : 38h15
Restaurant administratif
Site de l'École vétérinaire arboré sur 52 hectares
Protection sociale complémentaire : prise en charge partielle de la cotisation de base (sous conditions)
Transports en commun : participation de l'employeur à hauteur de 75% (sous conditions)
Forfait mobilité durable : entre 100 et 300€ par an (sous conditions) -
Vacant à partir du 01/09/2025
-
Experte / Expert en biologie et expérimentation animale