Ingenieur d'etudes en analyse d'image (H/F)

Référence : UMR144-EDWNOR-003

  • Fonction publique : Fonction publique de l'État
  • Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
  • Localisation : 75248 PARIS 05 (France)
Domaine : Recherche
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  • Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
  • Nature du contrat Non renseigné
  • Expérience souhaitée Non renseigné
  • Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels à partir de 2572 € brut mensuel selon expérience € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
  • Catégorie Catégorie A (cadre)
  • Management Non renseigné
  • Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

Missions :
Dans le cadre du project ScalingRules (ANR Chaird’Excellence France 2030), le laboratoire du Dr Basto recrute un/une IE en analyse dI’image a temps plein pour contribuer aux recherches du labo qui vise a comprendre comment les cellules polyploides regulent leur taille optimalle en assurant leur function. Cela, s’inscrit dans le projet globale du laboratoire visant a etudier les transitions de ploidie, cycle cellulaire et mantiens de stabilite genetique. Ce poste est idéal pour une personne ayant une formation en analyse quantitative d’images et une expérience de l’utilisation de Python, à la fois avec des techniques classiques de traitement d’images (seuillage, filtres, etc.) et des frameworks d’apprentissage profond.
Activités :
-Analyser des images biomédicales issues de différentes plateformes de microscopie (par exemple : confocale, light-sheet, fluorescence, microscopie électronique).
- Développer et appliquer des pipelines de traitement d’images en Python (par exemple à l’aide de bibliothèques telles que NumPy, SciPy, OpenCV, scikit-image et TensorFlow/PyTorch).
- Automatiser les tâches de segmentation, de quantification et de classification à l’aide de techniques d’apprentissage automatique et d’apprentissage profond.
- Collaborer avec des biologistes et des cliniciens afin d’interpréter les données d’imagerie et de soutenir des recherches guidées par des hypothèses.
- Maintenir des flux de travail d’analyse reproductibles à l’aide de systèmes de contrôle de version (par exemple Git) et de notebooks Jupyter.
- Aider à la préparation des données pour les publications et les présentations.

Contexte de travail :
Ce travail peut prévoir des déplacements en mission dans le cadre d’un temps horaire définit par le contrat de travail (quotité à 100%) et peut nécessiter une habilitation à un temps de travail avec une autorisation hors heures ouvrées.

Profil recherché

Competences :
- Diplôme en en informatique, en physique, en bioinformatique ou dans un domaine similair
- Maîtrise de Python et expérience avec des bibliothèques d’analyse d’images (par exemple OpenCV, scikit-image, Pillow ou équivalent).
- Une bonne connaissance des frameworks d’apprentissage automatique (SVM, forêts aléatoires).
- Capacité à travailler de manière autonome et collaborative dans un environnement de recherche multidisciplinaire.
- Excellentes compétences en communication et sens du détail.
- Capacité à acquérir de nouvelles compétences techniques spécifiques aux projets de recherche
- Capacité à gérer et archiver les données produites conformément aux règles et outils du laboratoire
- Maîtrise de l'anglais scientifique de niveau B2 (écrit et parlé)
- Capacité à organiser et prioriser les tâches
- Capacité à suivre des pratiques de recherche éthiques, y compris dans les interactions liées au travail avec des collègues

Contraintes et risques :
Nécessité de maîtriser des outils complexes (algorithmes de vision par ordinateur, apprentissage automatique, deep learning, bibliothèques spécialisées comme OpenCV, PyTorch, etc..
Posture sédentaire et exposition prolongée aux écrans et donc fatigue visuel.

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents
  • Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)

Langues

  • Français Seuil

Qui sommes-nous ?

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.

C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.

En savoir plus sur l'employeur

À propos de l'offre

  • Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

  • Vacant

  • Experte / Expert en biologie - SVT

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