ingénieur d'études (H/F) en bioinformatique
Référence : UMR5261-JULGON-011
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 69008 LYON 08 (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
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Nature du contrat
CDD d'1 an
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels à partir de 2491€ brut mensuel selon expérience € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Missions :
Le candidat participera aux projets bioinformatiques développés au sein de l’équipe.
Il devra :
• analyser et résoudre les problématiques bioinformatiques dans le cadre des programmes de recherche
• concevoir, développer et déployer des outils bio-informatiques
• réaliser la gestion et l'analyse des données « omiques »
Activités :
Formaliser un problème scientifique en terme technique.
Assurer la veille technologique dans le domaine et tester de nouvelles approches.
Conseiller pour le choix de méthodologies lors de l'élaboration d'un projet scientifique, et dans leur mise en œuvre.
Développer des outils de traitements automatisés de données biologiques et les appliquer dans le cadre de programme de recherche.
Rédiger des protocoles d’utilisation des outils et des méthodes mises en place.
Créer des bases de données permettant le stockage, la gestion et l'analyse des données produites par les projets d'étude des génomes, transcriptomes…
Assurer le transfert de connaissances et des savoir-faire (animation de réunions bio-informatiques, formations et/ou encadrement des scientifiques (partenaires en accueil, stagiaires et étudiants)).
Apporter une assistance et un support technique en bio-informatique aux membres de l’équipe
Contexte de travail :
L'agent sera recruté dans l'équipe "environnement des cellules souches musculaires et homéostasie du muscle strié squelettique" dirigée par Bénédicte Chazaud à l'Institut NeuroMyoGène de Lyon (UCBL1, CNRS5261, INSERM1315). Les travaux de notre équipe visent à comprendre la régulation du tissu musculaire et des types cellulaires (cellules souches, cellules immunes, vaisseaux...) qui le composent dans des contextes physiologiques (e.g., exercice, blessure musculaire) et pathologiques (dystrophies musculaires, cachexie liée au cancer, choc septique...)
Profil recherché
Competences :
Avoir des connaissances en biologie moléculaire et cellulaire et en physiologie du système neuromusculaire
Avoir des connaissances approfondies dans le domaine de la bio-analyse et la bio-informatique
Maitriser au moins un langage de programmation parmi Perl, Python, Java, R, PHP et des technologies Web (JQuery, JSON…).
Connaissance des problématiques liées aux Big Data.
Maitriser les systèmes d'exploitation Linux.
Posséder des qualités rédactionnelles et de communication.
Savoir gérer le stockage et la manipulation des données de grande dimension
Savoir formuler une problématique scientifique en termes techniques.
Maîtriser l’anglais
Contraintes et risques :
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 6 Licence/diplômes équivalents
- Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Experte / Expert en biologie - SVT
