Ingénieur de recherche en analyse bio-informatique des éléments transposables et de leur ARNs régulateu
Référence : UMR7261-AICBEL-032
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 37200 TOURS (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
- Nature du contrat Non renseigné
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) 2847,42 euros brut € brut/an
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Missions :
Institut de Recherche sur la Biologie de l’Insecte (IRBI) UMR 7261 CNRS – Université de Tours
Présentation du poste : L’ingénieur exercera son activité au CNRS, à l'IRBI, dans le cadre du Projet INVATRANSPO (Projet ANR) sur le volet concernant la dysgénèse hybride entre deux sous-espèces de la guêpe parasitoïde Cotesia congregata -Le projet a pour objectif d’identifier et d’étudier l’impact d’un élément transposable dans la spéciation sympatrique en cours entre ces deux sous espèces spécialisées sur des hôtes différents.
Présentation de l’équipe : L’ingénieur travaillera au sein de l’équipe IMIP : Interactions Micro-organismes-Insectes-Plantes de l’IRBI et collaborera également avec les collègues du iGRED (Clermont-Ferrand), partenaires du projet INVATRANSPO. Au sein de la thématique « évolution des génomes des parasitoïdes et de leurs virus endogène», le travail sera encadré par Dr Thibaut Josse (MCU Université de Tours) et Dr Jean-Michel Drezen (DR CNRS).
Activités :
Le but de ce poste est de comparer les génomes de guêpes parasitoïde et d’analyser en détail leurs éléments transposables afin d’identifier un ou plusieurs élément(s) actif(s) différentiellement régulé(s) par la réponse immunitaire génomique faisant intervenir les piRNA comme candidat crédible responsable de la stérilité partielle des croisements entre les deux sous espèces mise en évidence par des études précédentes.
Un deuxième aspect du projet est d’utiliser une approche de génomique comparative afin d’identifier d’autres facteurs génétiques impliqués dans la spécialisation sur les différents hôtes en particulier au niveau du virus endogène (bracovirus) associé à ces espèces et impliqué dans la réussite parasitaire.
Contexte de travail :
L’Institut de Recherche sur la Biologie de l’Insecte (IRBI) se consacre à l’analyse des interactions entre les insectes et leur environnement biotique et abiotique. L’IRBI est doté d’une force vive et dynamique de 27 chercheurs/enseignants-chercheurs permanents. L'institut s'appuie également sur les compétences de nombreux post doctorants et chercheurs contractuels ainsi que 18 doctorants pour un effectif global de 75 personnes. L’IRBI organise de façon régulière des séminaires scientifiques sur de thèmes variés liés aux insectes.
Profil recherché
Competences :
Le/la candidat(e)s doivent avoir une très bonne compétence en bio-informatique : assemblage et analyse des génomes et l’expérience de l’utilisation d’un cluster de calcul (SLURM) des logiciels REPET PanREPET et sRNAPipe ainsi que de l’annotation de piRNA cluster et de virus endogènes. Une expérience préalable avec les insectes parasitoïde sera un plus.
Contraintes et risques :
Une mission d’un mois est à prévoir aux Etats-Unis pour une collecte sur le terrain sur des arbres (jardins plantés de Catalpa). Des missions entre l’IRBI à Tours et le iGRED à Clermont Ferrand sont à prévoir.
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents
- Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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Expérience souhaitée : Expérience en assemblage et analyse bio-informatique des génomes d’hyménoptères
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Experte / Expert en expérimentation, instrumentation et techniques biologiques
