ingénieur de recherche en analyse de données biologiques (H/F)

Référence : UMR9002-SOFKOS-052

  • Fonction publique : Fonction publique de l'État
  • Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
  • Localisation : 34396 MONTPELLIER (France)
Domaine : Recherche
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  • Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
  • Nature du contrat Non renseigné
  • Expérience souhaitée Non renseigné
  • Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) à partir de 2875 € bruts mensuels, ajustable selon experience € brut/an
  • Catégorie Catégorie A (cadre)
  • Management Non renseigné
  • Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

Missions :
Mise au point d’outils pour la visualisation graphique et l’interprétation de l’analyse des répertoires exprimés des Immunoglobulines (IG) et des récepteurs T (TR), récepteurs d’antigènes des cellules B et T respectivement.
Les répertoires analysés à visualiser seront issus des résultats d’IMGT/HighV-QUEST, le logiciel d’IMGT® (the international ImMunoGeneTics information system®, https://www.imgt.org/), dédié à l’analyse haut-débit des séquences réarrangées IG et TR de l’homme et autres espèces de vertébrés.

Activités :
- Développement d’outils de visualisation des données des répertoires exprimés des IG et TR de cellules B et T.
- Amélioration d’outils d’analyse des données tel que IMGT/StatMutations, dédié à la caractérisation des mutations somatiques dans les séquences IG.
- Intégrer ces outils avec des outils d’IMGT déjà existant tel que IMGT/HighV-QUEST
- Diffuser et valoriser les résultats.
- Travaille en équipe et interactions avec des biologistes et bio-informaticiens.

Contexte de travail :
https://www.imgt.org/

Profil recherché

Competences :
- Compétences en programmation dans les langages JavaScript et R
- Connaissance en bash et python
- Connaissance souhaitable en shiny
- Compétence en visualisation des données
- Analyse de gros jeux de données
- Connaissances en immunogénétique serait un plus
- Bonne maîtrise de l'anglais
- Aptitude à travailler en équipe

Contraintes et risques :
Travail sur ordianteur.

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
  • Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)

Langues

  • Français Seuil

Qui sommes-nous ?

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.

C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.

En savoir plus sur l'employeur

À propos de l'offre

  • Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

  • Vacant

  • Experte / Expert en expérimentation, instrumentation et techniques biologiques

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