Ingénieur de recherche en analyse de l'image H/F

Référence : UMR3691-ZAEMAR-003

  • Fonction publique : Fonction publique de l'État
  • Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
  • Localisation : 75724 PARIS 15 (France)
Domaine : Recherche
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  • Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
  • Nature du contrat Non renseigné
  • Expérience souhaitée Non renseigné
  • Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels entre 3081,33€ et 4756,76€. € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
  • Catégorie Catégorie A (cadre)
  • Management Non renseigné
  • Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

Missions :
Sous la responsabilité de l’équipe recherche et développement de la plateforme d’imagerie photonique de l’institut Pasteur, UTechS Photonic Bio Imaging (PBI), il/elle travaillera sur l'analyse des données smFISH. L'objectif principal sera le développement d'un pipeline d'analyse automatisé pour segmenter les cellules, détecter des molécules d'ARN individuelles, et décrire leur localisation intracellulaire. Un aspect important sera l'établissement d'un benchmark quantitatif des implémentations récentes de différentes méthodes de détection de points.
Activités :
• Acquérir les compétences nécessaires (microscopie, smFISH).
• Analyse d'images
• Discussion avec les partenaires du projet sur leurs besoins et communiquer avec le reste de l’équipe des résultats et développement en cours.

Contexte de travail :
Le poste financé par "Financement Tech Transfert France Bioimaging" est localisé au sein de la plateforme "Photonic Bio Imaging" (PBI) (https://research.pasteur.fr/en/team/photonic-bioimaging-utechs-pbi/) de l’Institut Pasteur et s'exerce en interaction avec l’équipe « Imagerie quantitative de l’ARN » dirigée par Florian Muller (https://research.pasteur.fr/fr/member/florian-muller/) .
Le candidat sera sous la responsabilité de Florian Muller.
Vous disposerez d’un restaurant d’entreprise, de deux cafétérias. L’institut Pasteur dispose d’un comité d’entreprise auquel vous aurez accès.


Profil recherché

Competences :
• Connaissance de la microscopie optique en générale.
• Une bonne maitrise en analyse d'images en Python.
• Connaissances en vision artificielle et en apprentissage profond sont un plus.
• Curiosité scientifique et intérêt pour les thématiques liées à la santé publique
• Pouvoir s’intégrer à une équipe dynamique dans un milieu multiculturel et multidisciplinaire.
• Savoir communiquer en Anglais scientifique

Contraintes et risques :

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
  • Spécialisation Formations générales

Langues

  • Français Seuil

Qui sommes-nous ?

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.

C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.

En savoir plus sur l'employeur

À propos de l'offre

  • Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

  • Vacant

  • Chercheuse / Chercheur

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