Ingénieur de recherche en bio-informatique
Référence : 2024-1546013
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
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Employeur :
Université de Montpellier
Université de Montpellier Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier - Localisation : Montpellier
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
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Nature du contrat
CDD d'1 an
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) 26 - 32 k € brut/an
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non
- Télétravail possible Oui
Vos missions en quelques mots
Mission principale :
Analyser et intégrer des données multi-omiques en formats bulk et cellules uniques (priorité : RNAseq et proteomic/CyTOF, puis ATAC-seq, métabolomique, épitranscriptomique, etc.), exploiter les réseaux d'interactions moléculaires dans ce processus d'intégration, inférence de réseaux nouveaux, en particulier de réseaux intercellulaires. Participer à la définition de plans d'expériences avec les biologistes du projet. Echanger avec eux en cours d'analyse pour faciliter la compréhension des résultats et maximiser leur pertinence.
Activités :
Analyse et intégration de données via le développement de scripts R et/ou python ainsi que l'application d'outils existants. Intégration avec des données publiques existantes par ailleurs, organisation et structuration des données.
Profil recherché
Compétences / Qualifications :
Données omiques et leur intégration, transcriptomique, protéomique, transcriptomique en cellules uniques, biologie des systèmes, machine learning, network science, algorithmes sur graphes.
Programmation en R et éventuellement python, gestion de données et de workflows. Bioinformatique, communication, organisation, esprit d'équipe, savoir-être, implication et rigueur.
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
Localisation
Éléments de candidature
Documents à transmettre
Pour postuler à cette offre, l'envoi du CV et d'une lettre de motivation est obligatoire
Qui sommes-nous ?
Une université d’excellence
Université de recherche intensive, leader mondial en écologie, l’Université de Montpellier est un établissement public expérimental qui figure dans le top 200 du classement de Shanghai. Elle couvre plusieurs champs disciplinaires sciences et techniques, droit, économie, environnement, administration, gestion, médecine, pharmacie, activités physiques et sportives, biologie, informatique, sciences de l’éducation, science politique. Elle a obtenu en 2022 la labellisation I-SITE (Initiative Science Innovation Territoires Economie) qui associe 15 partenaires de recherche et d’innovation du territoire. Ce Programme d'Excellence (PEI) porté par l’Université de Montpellier s’articule autour des enjeux "Nourrir, Soigner, Protéger" et s’appuie sur tous les domaines scientifiques de l'Université et de ses partenaires. Elle coordonne le Pôle Universitaire d’Innovation (PUI).
Une université engagée
En lutte contre toutes les formes de discrimination, l’Université de Montpellier est engagée pour la promotion de la diversité, l’égalité entre femmes et hommes et pour l’inclusion des personnes en situation de handicap. L’UM place aussi le développement durable au cœur de sa politique et de son savoir-vivre. Une démarche saluée par le palmarès du Times Higher Education qui la place en tête des universités françaises les plus performantes en terme de développement durable.
Descriptif du service
Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellie.
Au coeur du Campus du Cancer de Montpellier, l'IRCM avec tous ses partenaires stimule l'innovation en termes de recherche et d'enseignement dans la lutte contre le cancer. Notre équipe METECOL dirigée par le Dr. Jean-Emmanuel Sarry étudie les résistances thérapeutiques dans un cancer modèle (les Leucémies Aiguës Myéloïdes, LAM). Malgré l'efficacité des chimiothérapies et l'arrivée de thérapies ciblées, les rechutes restent fréquentes et le pronostic vital des patients atteints, faible.
Nous avons mis en évidence que la résistance aux traitements des cellules LAM nécessite une adaptation de leur métabolisme. Ainsi notre projet est de caractériser la réponse métabolique et mitochondriale aux chimiothérapies conventionnelles et aux nouvelles thérapies ciblées en utilisant des modèles précliniques murins. Cette étude contribuera à élucider in vivo les mécanismes de résistance à la thérapie et fournira surtout des outils nécessaires pour tester de nouveaux agents thérapeutiques, pouvant cibler spécifiquement l'éradication des cellules résistantes. Ainsi, le projet de recherche de l'équipe est basé sur des modèles de type «patient-derived xenograft, PDX». Pour cela, l'équipe collabore étroitement avec des équipes de chercheurs et cliniciens de Toulouse et de Montpellier. Par ailleurs, nous caractérisons les populations de cellules résistantes par des approches multi-omiques et en cellules uniques.
À propos de l'offre
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Dépôt CV et Lettre de Motivation : https://umemplois.umontpellier.fr/poste/2024-R0208
Référence de l’offre à rappeler dans votre lettre de motivation : 2024-R0208
Clôture des candidatures le 19/05/2024 à 23h59
Contacts :
· organisation du recrutement : drh-recrut-biats@umontpellier.fr / 04 67 14 99 30
Renseignements sur le poste : jean-emmanuel.sarry@inserm.fr
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Vacant à partir du 03/06/2024
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Experte / Expert en information statistique
