Ingénieur d’étude en neuroimagerie : Analyses de connectivité cérébrale fonctionnelle chez le macaque (
Référence : UMR5229-SULBEN-022
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 69675 BRON (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
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Nature du contrat
CDD d'1 an
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels à partir de 2521€ brut mensuel selon expérience € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Missions :
• Organiser et contribuer à l’analyse des données IRM fonctionnelles.
• Assurer la traçabilité, la gestion et la sauvegarde des données.
• Participer à la mise à jour des pipelines d’analyse.
• Contribuer à la rédaction de rapports et figures scientifiques pour les livrables du projet et publications.
• Participer à la préparation des sessions IRM anesthésiées (coordination logistique, préparation des protocoles, suivi des données).
• Assister ponctuellement les équipes partenaires à Marseille pour les acquisitions IRM (préparation, suivi technique).
Activités :
• Prétraiter et analyser les données IRM fonctionnelles issues d’un suivi longitudinal chez le macaque (rs-fMRI).
• Mettre en œuvre et adapter les pipelines d’analyse (AFNI, FSL, ANTs, Workbench, Python/MATLAB) selon les besoins scientifiques.
• Appliquer des modèles statistiques de connectivité fonctionnelle (LME, ICA, seed-based analyses) pour l’étude du développement cérébral et de ses altérations.
• Participer à la préparation, au suivi et à la gestion des sessions d’acquisition IRM anesthésiées (en lien avec les équipes partenaire).
• Assurer la qualité, la traçabilité et la sauvegarde des données sur les serveurs du CNRS (documentation, archivage).
• Générer les figures, tableaux et rapports nécessaires aux livrables scientifiques et publications du projet.
• Participer aux réunions de coordination entre partenaires et aux échanges réguliers sur les analyses en cours.
• Contribuer à la veille méthodologique et au transfert de compétences au sein de l’équipe (formation des étudiants, mise à jour des outils).
Contexte de travail :
Le poste est basé à l’Institut des Sciences Cognitives Marc Jeannerod (CNRS, Lyon), dans l’équipe dirigée par le Pr. Suliann Ben Hamed.
L’ingénieur·e participera à un projet financé par l’ANR, qui explore les effets de l’adversité sociale précoce sur le développement cérébral et comportemental du macaque. Des déplacements ponctuels à l’Institut de Neurosciences de la Timone (Marseille) sont à prévoir.
Profil recherché
Competences :
• Licence (master apprécié) en neurosciences, neuroimagerie ou traitement du signal
• Maîtrise des outils d’analyse de données IRM (FSL, AFNI, SPM, Workbench, Python ou MATLAB).
• Connaissances des approches de connectivité fonctionnelle et/ou de modélisation statistique (GLM, LME, ICA).
• Bonnes pratiques de gestion de données et de reproductibilité (Git, scripts, documentation).
• Capacité à travailler en équipe pluridisciplinaire (neurosciences, imagerie, éthologie).
• Interactions fréquentes avec plusieurs équipes et plateformes techniques, demandant une bonne capacité d’adaptation, de communication et de coordination.
• Autonomie, rigueur, et sens de l’organisation.
• Bon niveau d’anglais scientifique.
• Une expérience préalable en neuroimagerie animale (macaque ou rongeur) seront des atouts appréciés.
Contraintes et risques :
• Travail en environnement de recherche biomédicale et primatologique, nécessitant le respect strict des règles d’hygiène, de sécurité et de confidentialité.
• Accès ponctuel à des plateformes d’imagerie IRM 3T et à des zones expérimentales soumises à des procédures spécifiques (autorisation d’accès, formation sécurité, conformité éthique).
• Déplacements occasionnels pour la préparation et le suivi des sessions d’imagerie sous anesthésie.
• Contraintes horaires ponctuelles liées aux calendriers d’acquisition et à la coordination inter-sites.
• Exposition à des données sensibles imposant une vigilance particulière en matière de sécurité informatique et de confidentialité.
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 6 Licence/diplômes équivalents
- Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Experte / Expert en expérimentation, instrumentation et techniques biologiques
