Ingénieur d’études en bio-informatique (H/F)
Référence : UMR9191-ARNLER-005
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 91198 GIF SUR YVETTE (France)
Partager la page
Veuillez pour partager sur Facebook, Twitter et LinkedIn.
- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
-
Nature du contrat
CDD d'1 an
- Expérience souhaitée Non renseigné
-
Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels 2 540,99 € et 2 711,10 € brut mensuel selon expérience € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Missions :
CDD 12 mois, Ingénieur d’études en bio-informatique et génomique pour l’administration logicielle et la gestion, le traitement et l’analyse des données.
Activités :
- Recenser et répertorier les outils bio-informatiques et bio-statistiques fréquemment utilisés au laboratoire (par exemple dans le domaine de l’annotation, la génétique d’association, phylogénie, génomique des populations et évolution moléculaire, analyse d’image, etc). Tester et comparer les logiciels concurrents.
- En collaboration avec les services informatiques du laboratoire EGCE et de l’institut IDEEV, définir et mettre en œuvre les procédures de maintenance de la pile logicielle dédiée aux analyses bio-informatiques sur les serveurs communs du laboratoire.
- Assurer la mise en place d’une procédure d’accueil et de formation des nouveaux entrants, animer un atelier bio-informatique à destination des utilisateurs. Promouvoir les bonnes pratiques scientifiques (reproduction, traçabilité, Open Science) et techniques (utilisation d’infrastructures communes, serveurs du laboratoire et plateformes collaboratives).
- Apporter conseil et aide dans les projets de recherche développés au laboratoire.
Contexte de travail :
Le laboratoire EGCE est une des trois UMR installées dans l'Institut Diversité, Ecologie et Evolution du Vivant (IDEEV) situé dans le campus de l'Université Paris Saclay. L'UMR EGCE regroupe des équipes de recherche utilisant de plus en plus de grandes quantités de données de séquences, obtenues par des technologies de séquençage “haut débit”, pour étudier des questions multiples en écologie et en évolution. Le traitement, la gestion et l’analyse de ces données génomiques représentent un fort goulet d’étranglement, qui ne peut que s’accroître étant donnés le développement rapide et la baisse des coûts des technologies de séquençage haut-débit. Pour rester à la pointe de la recherche en écologie et évolution, y compris en termes de bonnes pratiques scientifiques (données ouvertes, archivage, reproductibilité), il apparaît indispensable de disposer d’un appui technique avec des compétences dans l’analyse de données génomiques.
Profil recherché
Competences :
Connaissance générale des analyses bio-informatiques, en particulier sur des données génomiques et transcriptomiques. Maîtrise des outils de gestion et langages de la pile logicielle courante pour l’analyse de données de séquence (Unix, shell, python, java, R, conda) et de l’administration de systèmes Unix pour la bio-informatique.
Avoir le sens de l’organisation, du travail en équipe, et savoir transmettre des connaissances et animer un groupe de travail.
Langue anglaise : B1 minimum.
Contraintes et risques :
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents
- Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
-
Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
-
Vacant
-
Experte / Expert en expérimentation, instrumentation et techniques biologiques
