Ingénieur d’études (H/F) : Modélisation des structures latentes des connectomes neuronaux

Référence : UMR3571-CHRVES-004

  • Fonction publique : Fonction publique de l'État
  • Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
  • Localisation : 75724 PARIS 15 (France)

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  • Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
  • Nature du contrat Non renseigné
  • Expérience souhaitée Non renseigné
  • Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels Entre 2 571€ et 3 817€ € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
  • Catégorie Catégorie A (cadre)
  • Management Non renseigné
  • Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

Missions :
Ce projet vise à caractériser la structure latente des circuits neuronaux des réseaux neuronaux des petits animaux. Ce travail s'appuie sur un cadre génératif de modélisation de réseaux que nous développons dans le laboratoire, basé sur l'intégration des nœuds dans un espace métrique où les distances déterminent les probabilités de liaison à partir d'un noyau appris à partir des données. Nous souhaitons utiliser cette projection pour découvrir les structures topologiques latentes des réseaux et les relier aux rôles neuronaux et à leur intégration dans l'espace 3D réel, ainsi qu'à d'autres caractéristiques d'ordre supérieur telles que les motifs et les communautés.

Activités :
- Développer une procédure statistique permettant d'identifier les caractéristiques latentes significatives des connectomes neuronaux à partir des positions des neurones dans l'espace latent appris.
- Valider la méthodologie sur des réseaux synthétiques et l'appliquer à des connectomes à résolution synaptique de petits animaux.
- Comparer les positions latentes des neurones aux positions réelles de leur soma dans l'espace réel et relier les caractéristiques latentes déduites aux caractéristiques topologiques de connectomes et aux types, circuits et groupes de neurones connus.
- Éventuellement étendre la méthodologie aux fonctions noyau apprenables en utilisant la composabilité des noyaux.

Contexte de travail :
Au laboratoire, nous nous appuyons principalement sur la larve de Drosophila melanogaster comme animal modèle pour étudier ces questions. Son connectome complet, contenant ~12,000 neurones, a été cartographié à une résolution synaptique. En outre, une vaste boîte à outils génétique permet de cibler et de contrôler des neurones individuels chez des animaux au comportement libre. Des cribles à grande échelle ont révélé l'influence individuelle de milliers de neurones sur le comportement de millions de larves, et plusieurs microcircuits contrôlant des décisions et des actions comportementales spécifiques ont été identifiés.

Le.La candidat.e sélectionné.e travaillera dans un environnement interdisciplinaire mêlant physiciens, biologistes et mathématiciens.



Profil recherché

Competences :
Nous recherchons un.e candidat.e très motivé.e ayant une solide formation quantitative en physique ou en mathématiques appliquées (y compris, mais sans se limiter à, l'apprentissage automatique et la statistique). Une maîtrise de Python et des simulations numériques est attendue.
Contraintes et risques :

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents
  • Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)

Langues

  • Français Seuil

Qui sommes-nous ?

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.

C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.

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À propos de l'offre

  • Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

  • Vacant
  • Experte / Expert en biologie - SVT

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