Ingénieur-e biologiste en analyse de données H/F
Référence : 2025-1795040
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Inserm Délégation Régionale Paris IDF Centre Nord
- Localisation : UMR 1016 – Institut Cochin
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- Nature de l’emploi Emploi réservé aux fonctionnaires et lauréats d'un concours territorial
- Nature du contrat Non renseigné
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) Non renseigné
- Catégorie Catégorie A+ (Encadrement supérieur - Autres emplois fonctionnels)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Oui
Vos missions en quelques mots
Mission principale
Cette fiche de poste s’inscrit dans le cadre de la création de novo d’une plateforme de bio-informatique au sein de l’Institut Cochin. Celle-ci doit répondre à un besoin croissant des équipes de recherche en analyse de données de génomique / transcriptomique (analyse de la cellule unique).
Mettre en place, organiser et animer l’activité bio-informatique de l’Institut Cochin.
Réaliser la gestion et le traitement de données de génomique (analyse de la cellule unique).
Activités principales
Activité 1 : Co-animer et développer l’activité bio-informatique du site via un réseau interne déjà existant :
- Suivre régulièrement les projets menés sur le réseau : accompagner et conseiller les bio-informaticiens juniors en charge de ces projets, coordonner les actions menées sur un projet (interactions bio-informaticiens – biologistes par exemple).
- Organiser le fonctionnement quotidien du réseau et son animation : planning des présentations hebdomadaires, sélection des intervenants, recrutement des étudiants bio-informaticiens en charge d’un projet d’équipe, interactions avec d’autres plateformes bio-informatiques hors Institut, organisation de séminaires technologiques, interactions avec les différentes forces en bio-informatique du site (plateformes et équipes).
Activité 2 : Assurer un ensemble de prestation d’analyses bio-informatiques, dans le domaine de la transcriptomique de la cellule unique
- Réaliser le traitement des données de projets single cell, concevoir et mettre en place des outils innovants. Diffuser et valoriser les résultats.
- Encadrer des bio-informaticiens juniors (dans le cadre d’une prestation définie avec une équipe)
- Assurer une veille scientifique des méthodes d’analyse omiques de la cellule unique
Activité 3 : Diffuser et participer à la valorisation des réalisations de la plateforme sous forme de présentations lors de séminaires internes et externes. Organiser les relations avec d’autres plateformes bio-informatiques hors Institut (organisation de séminaires technologiques par exemple), interagir avec les différentes forces en bio-informatique du site (plateformes et équipes) …
Connaissances
- Connaissance de base en sciences de la vie et en biologie moléculaire.
- Connaissance approfondie de la génomique et des techniques qui s’y rapportent.
- Expression et compréhension orale et écrite en anglais (niveau 2).
Savoir-faire
- Maîtrise des méthodes et outils d’analyse et du traitement des données issues de séquençage à haut débit.
- Maîtrise des outils mathématiques et statistiques du traitement des données
- Maîtrise des langages de programmation indispensables : R, Python, Bash.
- Capacité à évaluer et garantir la qualité et la pertinence des outils d’analyse utilisés pour chaque projet
- Capacité à organiser l’activité bio-informatique au sein d’une plateforme : prévoir et animer des séminaires, des formations, interagir avec les responsables d’équipes
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
Localisation
Éléments de candidature
Documents à transmettre
À propos de l'offre
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Vacant à partir du 06/02/2025
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Experte / Expert en biologie - SVT
