Ingénieur-e biologiste en traitement de données (H/F)

Missions :
Microscopie à fluorescence hautement résolue, imagerie spectrale,
décomposition spectrale, analyse d’images, modélisation et quantification
L’ingénieur.e en microscopie mettra en œuvre une ou plusieurs techniques expérimentales de microscopie super-résolue spectrale conduisant à l'obtention de connaissances quantitatives sur des nanostructure comme cibles pour la calibration et la métrologie. Plus particulièrement, il ou elle utilisera les techniques d’imagerie multi-spectrale et de décomposition spectrale en microscopie par fluorescence (TIRF, SAF, light-sheet), d'analyse d’images quantitative et de modélisations/optimisiations. Il ou elle mettra en œuvre des essais optiques in-situ et participera potentiellement à la définition d’un nouveau standard microscopique.
Activités :
• Définir un ensemble de protocoles expérimentaux, adapté à un échantillon nanoscopique et aux finalités d'un projet scientifique
• Effectuer ou superviser la conduite des observations, expériences, traiter les données expérimentales, interpréter les résultats en relation avec les objectifs de recherche
• Former et assister des étudiants sur les principes et la mise en oeuvre d'une ou plusieurs techniques de caractérisation
• Gestion de la maintenance d’un microscope (alignement, mises à jour, intefaçage,contact avec les fournisseurs ou le SAV, passage de commande consommables), gestion et résolution des pannes
• Gestion d'échantillons test en lien avec des collaborateurs étrangers
• Participation à la définition d’un standard pour microscopies super-résolues (rédaction d'un cahier des charges ; réalisation d'essais comparatifs entre différents fournisseurs ; définition de grilles de tests multi-matériaux ; organisation de réunions avec les fournisseurs ; suivi de projet)
• Diffuser et valoriser ses résultats sous forme de rapports techniques, publications ou communications
• Gestion du matériel optique et microscopique
• Intégration des données issues des mesures effectuées avec les données obtenus
préalablement par des techniques de nanocaractérisation
• Veille technologique
Contexte de travail :
’activité de l’ingénieur.e s’inscrit dans le périmètre du projet NANOSCALE (voir https://
nanoscale.sppin.fr) qui a pour but d’avancer la métrologie en microscopies à super-résolution,
faciliter la microscopie à fluorescence quantitive et de donner aux ingénieurs et chercheurs
d’outils pour des mesures plus précises de la position des fluorophores le long l’axe optique. Ce
projet, initialement financé par un contrat UE, a récemment connu une extension visant la
calibration de la position axiale des fluorophores par la couleur, activité qui ajoute notamment un
volet spectroscopique à notre projet.
Le travail s'effectuera au laboratoire Saints Pères Paris Institute for the Neurosciences (SPPIN,
http://sppin.fr ) Unité Mixte de Recherche (UMR) possédant deux tutelles : le CNRS et l’UPC. Le
SPPIN est situé dans Par
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