Ingénieur-e biologiste en traitement de données H/F
Référence : UPR3212-MOBINT-Z53015
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 67000 STRASBOURG (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert aux titulaires et aux contractuels
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) Non renseigné
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Mission :
L'ingénieur-e sera chargé-e d'organiser la collecte et de réaliser la gestion et l'analyse de données
« omics » (notamment transcriptomiques, épigénomiques et protéomiques) pour les équipes de 2
laboratoires de neurosciences strasbourgeois : l'Institut des Neurosciences Cellulaires et
Intégratives (INCI) et le Laboratoire de Neurosciences Cognitives et Adaptatives (LNCA).
Il/elle travaillera en interaction avec les biologistes de ces laboratoires et les informaticiens des
plateformes haut-débit générant les données (Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et
Cellulaire - IGBMC, Institut de Biologie Moléculaire des Plantes - IBMP, etc.).
Activité :
- Mettre en place et optimiser les procédures de recueil et de contrôle des données,
- Réaliser l'analyse des données issues de l'INCI et du LNCA en mettant en place les outils d'analyses
et les outils statistiques adéquats,
- Interagir avec les neurobiologistes de l'INCI et du LNCA pour optimiser les schémas expérimentaux et
aider à l'interprétation des données,
- Développer de nouveaux outils d'analyse adaptés aux questions scientifiques soulevées par les
données (e.g. développement de nouveaux pipelines pour intégrer différents types de données omics), en
interaction notamment avec les personnels des plateformes locales (IGBMC, IBMP),
- Organiser la mise en forme, le stockage et la maintenance des données issues de l'INCI et du LNCA,
en collaboration avec les plateformes et structures (DataCenter) locales,
- Diffuser et valoriser des résultats sous forme de rapports techniques ou d'études,
- Gérer et maintenir des outils informatiques partagés,
- Conseiller les utilisateurs, voire former les membres de l'INCI et du LNCA à certains outils,
- Assurer une veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité, notamment en
participant à des réseaux professionnels.
Profil recherché
Contexte :
L'environnement de travail est celui du site de l'Esplanade de l'Université de Strasbourg, en
centre-ville, accessible en transports en commun et disposant d'une possibilité de restauration.
L'unité d'affection (l'INCI) se situe dans un bâtiment CNRS du campus et la seconde unité est à 7
min à pied dans des locaux historiques avec jardins attenants. L'activité se répartira à raison de
50% du temps de travail passé dans chacun des 2 laboratoires d'accueil (INCI, LNCA) en fonction des
projets. Ces 2 laboratoires de neurosciences fusionneront au prochain contrat quinquennal.
Sur le plan administratif, le poste est rattaché à l'INCI. L'ingénieur-e mènera ses activités au
sein d'un plateau de biologie moléculaire et bioinformatique en mutualisation entre les 2 unités, et
sera sous la responsabilité hiérarchique d'un des responsables du plateau.
Le besoin est lié à l'évolution forte des études de génomique fonctionnelle en neurosciences,
faisant aujourd'hui appel aux techniques « omics » (analyses transcriptomiques, épigénomiques et
protéomiques). Les équipes de l'Institut des Neurosciences Cellulaires et Intégratives mènent des
recherches sur la douleur (traitements et comorbidités psychiatriques), les troubles
neuropsychiatriques (addictions, dépression), la communication au sein des systèmes nerveux et sur
les rythmes biologiques journaliers et saisonniers. Le laboratoire de Neurosciences Cognitives et
Adaptatives étudie plus particulièrement les processus cognitifs et mnésiques, le vieillissement et
les maladies neurodégénératives
Competence :
Connaissances :
- Connaissances approfondies en bioinformatique et biostatistiques,
- Connaissances approfondies dans le recueil, l'analyse statistique et le traitement des données,
- Connaissances générales en biologie moléculaire et génomique et connaissance des principales
banques de données biologiques,
- Connaissances des bonnes pratiques pour la gestion des données de la recherche,
- Langue anglaise : B1 à B2 selon le cadre européen commun de référence pour les langues.
Savoir-faire :
- Maîtriser l'environnement unix (Shell) et au moins un langage de programmation (R de préférence),
- Analyser des données haut-débit, issues notamment de séquençage de nouvelle génération (« Next-
Generation Sequencing »),
- Interagir avec des neurobiologistes et des bioinformaticiens,
- Garantir la qualité et la pertinence des outils d'analyse et des résultats,
- Transmettre des connaissances.
Savoir être :
- Esprit d'équipe,
- Sens de l'organisation,
- Rigueur, fiabilité,
- Autonomie.
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 6 Licence/diplômes équivalents
- Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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Campgane printemps 2024
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Experte / Expert en biologie - SVT
