Ingénieur-e d'études en bioinformatique
Référence : 2025-1977614
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : INSERM-Délégation Régionale IDF Centre-Est
- Localisation : 25 rue d'Ulm 75005 Paris
Partager la page
Veuillez pour partager sur Facebook, Twitter et LinkedIn.
- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
- Nature du contrat Non renseigné
- Expérience souhaitée Non renseigné
-
Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels Non renseignée Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Oui
Vos missions en quelques mots
Mission principale:
La personne recrutée aura pour mission d’étudier le rôle des éléments transposables et des modifications épigénétiques dans l’activation mécanosensible des cellules dendritiques. Les changements de forme de la cellule et de son noyau au cours de la migration dans les tissus induisent des changements de leur transcriptome, via l’activation de la voie cPLA2 (Alraies et al, 2024, publication du laboratoire). Différentes études ont démontré dans des cellules non immunitaires qu’une déformation induisait des modifications épigénétiques, conférant aux cellules déformées une mémoire de leur déformation et favorisant leur différentiation (S. Wickstrom, collaborateur de l’équipe). Nous souhaitons voir si de telles régulations sont en jeu dans les cellules dendritiques et si les éléments transposables, connus comme régulant les marques épigénétiques, pourraient jouer un rôle ici. Nous savons que les cellules dendritiques doivent se déformer suffisamment et suffisamment longtemps pour activer des changements transcriptomiques. La régulation des éléments transposables pourrait ainsi constituer la base moléculaire de leur mémoire.
Les missions de la personne recrutées seront de :
- Quantifier l’expression différentielle des TEs, en sous familles et en éléments uniques, sur des données de BulkRNAsequençage, induites par les déformations mécaniques
- Identifier les mécanismes moléculaires sous-tendant ces régulations
- Caractériser le rôle des TEs dans la régulation des gènes, et évaluer les conséquences en terme de mémoire pour les cellules dendritiques
- Évaluer l’hétérogénéité des réponses des cellules dendritiques dans différents contextes physiopathologiques dans lesquels les déformations subies varient (tumeur, fibrose), grâce à l'analyse de données en single-cell RNA séquençage
Ces objectifs rentrent dans le cadre de l’objectif 5 de l’ERC SHAPINCELLFATE (Projet 101071470).
Activités principales:
· Analyser des données et interprétation des résultats (transcriptomiques et épigénétiques)
· Préparer des validations expérimentales avec les biologistes
· Effectuer une veille bibliographique, rapport et présentation en anglais
Profil recherché
- Connaissances:
· Eléments Transposables
· Epigénétique
· Immunologie
· Mécanobiologie
· Protocoles expérimentaux
· Cadre légal et déontologique
· Langue anglaise: B2 (cadre européen commun de référence pour les langues)
- Savoir-faire:
· Traiter des données informatiques : programmation en R, python, Bash
· Traiter des données informatiques : Seurat, Dplyr, DEseq2, ggplot2
· Interagir avec des biologistes et des informaticiens
· Garantir la qualité et la pertinence des outils d'analyse et des résultats
- Aptitudes:
· Travail en autonomie
· Travail d’équipe
· Fiabilité
· Sens critique
· Sens de l'organisation
Éléments de candidature
Personnes à contacter
- helene.moreau@curie.fr
- christel.goudot@curie.fr
Qui sommes-nous ?
L’Inserm est le seul organisme public français entièrement dédié à la recherche biologique, médicale et en santé des populations. Il dispose de laboratoires de recherche sur l’ensemble du territoire, regroupés en 12 Délégations Régionales. Notre institut réunit 15 000 chercheurs, ingénieurs, techniciens et personnels administratifs, avec un objectif commun : améliorer la santé de tous par le progrès des connaissances sur le vivant et sur les maladies, l’innovation dans les traitements et la recherche en santé publique.
Rejoindre l’Inserm, c’est intégrer un institut engagé pour la parité et l’égalité professionnelle, la diversité et l’accompagnement de ses agents en situation de handicap, dès le recrutement et tout au long de la carrière. Afin de préserver le bien-être au travail, l’Inserm mène une politique active en matière de conditions de travail, reposant notamment sur un juste équilibre entre vie personnelle et vie professionnelle.
L'Inserm a reçu en 2016 le label européen HR Excellence in Research et s'est engagé à faire évoluer ses pratiques de recrutement et d'évaluation des chercheurs.
Descriptif du service
Créée en 2005, l’Unité U932 INSERM est composée de 10 équipes, réparties sur deux bâtiments (Hôpital Curie et Bâtiment Constant-Burg, rue Lhomond), regroupant environ 120 personnes.
Les équipes de l’Unité tentent de mieux comprendre les réponses immunitaires, et d’apprendre au système immunitaire à mieux lutter contre les agents pathogènes et/ou les tumeurs. Les projets de recherche vont de l’immunologie fondamentale à l’immunothérapie translationnelle et à l’immunothérapie clinique chez des patients atteints de cancer. Ces approches comprennent, d’une part la biologie, la biochimie et les techniques d’imagerie moléculaires, basées à la fois sur des modèles expérimentaux in vitro et in vivo, et d’autre part, des études de surveillance immunologique, de diagnostic, de pronostic et d’immunothérapie chez les patients atteints de cancer.
À propos de l'offre
-
· CDD 12 mois
· Temps plein· Nombre d’heures hebdomadaires : 38h30
· Congés Annuels et RTT : 32 jours ouvrés et ARTT-12 jours maximum pour un agent travaillant à temps plein : 44 jours annuels
· Télétravail possible: Oui, 1j / semaine
· Rémunération Contractuels : A partir de 2 494,30 € brut mensuel, au-delà en fonction de l'expérience professionnelle sur des postes de niveau équivalent. -
· Travail en co-supervision par une biologiste (Hélène Moreau) et une bio-informaticienne (Christel Goudot)
· Environnement international : maitrise de l’anglais indispensable
-
Vacant à partir du 01/10/2025
-
Experte / Expert en biologie - SVT
