Ingénieur en Bioinformatique (H/F)

Référence : UMR6293-HEISER-004

  • Fonction publique : Fonction publique de l'État
  • Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
  • Localisation : 63000 CLERMONT FERRAND (France)
Domaine : Recherche
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  • Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
  • Nature du contrat Non renseigné
  • Expérience souhaitée Non renseigné
  • Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) A partir de 2847 € brut mensuel selon experience € brut/an
  • Catégorie Catégorie A (cadre)
  • Management Non renseigné
  • Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

Missions :
Nous recherchons un bioinformaticien très motivé pour travailler sur le projet ERC MeioPoly, qui vise à élucider les mécanismes de l'adaptation méiotique à l'allopolyploïdie. L'hybridation entre espèces apparentées conduit à la formation d'organismes allopolyploïdes confrontés à des changements génomiques, épigénomiques et transcriptomiques qui doivent être surmontés pour que cette nouvelle espèce survive. La recombinaison méiotique entre les sous-génomes (hérités des progéniteurs) peut conduire à des réarrangements génomiques hautement délétères et doit être évitée. En utilisant l'allotétraploïde Arabidopsis suecica comme modèle, le projet MeioPoly a pour objectif de décrypter les processus évolutifs permettant la stabilisation méiotique des jeunes allopolyploïdes.

Le candidat retenu développera des outils informatiques pour caractériser les variations génétiques, les réarrangements chromosomiques, ainsi que les changements épigénomiques et transcriptomiques pour élucider les bases de la stabilité méiotique et de la fertilité des allopolyploïdes naissants.
Activités :
- Développement de pipelines pour répondre aux questions biologiques posées
- Analyse de données NGS (RNA-seq, ChIP-seq...)
- Mise en forme des données en vue de l'écriture de publications
Contexte de travail :
La personne recrutée rejoindra l’équipe « Recombinaison et maintenance de l’intégrité du génome » de l’iGReD (Institut de Génétique, Reproduction et Développement) à Clermont-Ferrand en France. Les 15 équipes de recherche de l’iGReD ont pour objectif de comprendre les programmes génétiques et épigénétiques associés à la reproduction et au développement normal et pathologique, et fournissent un environnement scientifique dynamique et coopératif.

Profil recherché

Competences :
Les candidats doivent être titulaires d'un Master II ou d'un doctorat en bioinformatique.

- Capacité à développer des méthodes et des pipelines pour analyser, gérer et interpréter des jeux de données biologiques
- Excellentes compétences en programmation et solides capacités d'analyse et de résolution de problèmes
- Expertise en séquençage long reads (ONT), ChIP-seq et RNA-seq
- Capacité à travailler de manière autonome et en coopération avec les autres membres de l'équipe
- Maîtrise de l'anglais scientifique
Contraintes et risques :
n.a.

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents
  • Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)

Langues

  • Français Seuil

Qui sommes-nous ?

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.

C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.

En savoir plus sur l'employeur

À propos de l'offre

  • La date d'embauche est flexible (mi-novembre 2024 à février 2025).
    La durée du contrat est de 13 mois, renouvelable deux fois.

  • Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

  • Vacant

  • Experte / Expert en expérimentation, instrumentation et techniques biologiques

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