Ingénieur en développement logiciel et administration de système d'information (DevOps) pour l'imagerie

Missions :
Du fait d'une activité importante ces dernières années, l'équipe a monté une infrastructure de gestion de données et de calcul ainsi que développé divers logiciels métier associés. Les missions de la personne recrutée seront de (1) spécifier puis développer et/ou suivre la sous-traitance de logiciels web, client-serveur, pour la gestion des données (volet "Dev") et (2) d'assurer la maintenance, la mise à jour et le monitoring de l'infrastructure qui stocke les données, fait tourner les logiciels, et sert au calcul intensif (4-5 serveurs ; volet "Ops").
Activités :
Activités principales :

- Dev: spécification et développement d'applications métiers pour la gestion d'images (et leur traitement, dans une moindre mesure) et de métadonnées associées; codage et suivi de sous-traitants. Ces applications sont toutes basées sur des technologies web, avec un client et un serveur, connectés par une API.

- Ops: installation, mise à jour et suivi de systèmes d'exploitation et d'applications métier sous Linux

Autres activités : Discussions avec les membres de l'équipe et ses partenaires scientifiques pour l'identification des besoins. Formations possibles dans le cadre de la formation permanente pour la montée en compétence sur les domaines du poste non-maîtrisés.

Contexte de travail :
Le Laboratoire d'Océanographie de Villefranche (LOV ; http://lov.obs-vlfr.fr/) est situé près de Nice, sur la Côte d'Azur, dans l'une des trois stations marines de Sorbonne Université. Avec environ 120 employés, le LOV génère et analyse une grande quantité de données marines, notamment des données d'imagerie, génomiques et satellitaires, pour étudier l'océan.

L'équipe COMPLEx (COMPutational PLAnkton Ecology) compte une cinquantaine de membres qui étudient le plancton marin en collectant des données avec des instruments d'imagerie quantitative et de la génomique à haut débit, qui viennent alimenter des méthodes d'analyse numérique (modélisation, statistiques, apprentissage automatique). Le plancton englobe tous les organismes dérivant avec les courants marins. Ces organismes produisent une partie de l'oxygène que nous respirons, stockent le carbone que nous émettons, nourrissent les poissons que nous mangeons ; le plancton est donc un élément constitutif majeur de l'écosystème terrestre. COMPLEx interagit fortement avec la Plateforme d'Imagerie Quantitative de Villefranche (PIQv ; https://sites.google.com/view/piqv), qui supervise l’opération des outils que l'équipe développe. Ces outils incluent des capteurs d'imagerie, tels que l’Underwater Vision Profiler (UVP) ou le ZooScan. L'UVP6 est notamment en cours d'intégration sur des plateformes autonomes (i.e. des robots sous-marins) qui permettent de collecter des données à une échelle sans précédent. Mais ces outils incluent également un nombre croissant de logiciels : ZooProcess et UVPapp pour traiter les données produites par les instruments, EcoTaxa (https:
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