Ingénieur.e de Recherche en analyses génomiques de la diversité de plantes médicinales réunionnaises
Référence : 2025-1948317
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Institut de Recherche pour le Développement (IRD)
- Localisation : Saint-Pierre
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert aux titulaires et aux contractuels
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels Non renseignée Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Oui
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Votre mission principale sera de prendre en charge les analyses génétiques et génomiques des données du projet Qualitiz et leur valorisation.
Dans ce cadre, vos activités seront les suivantes :
- Etudier la diversité génétique des populations naturelles des espèces ciblées après génotypage par séquençage (méthode RADseq ou suite à un enrichissement par capture)
- Mener des analyses phylogénétiques, la clarification botanique de certains taxons, et l’étude de l’histoire démographique des espèces
- Pour 3 espèces, rechercher les facteurs génétiques et environnementaux contrôlant la biosynthèse de molécules bioactives ciblées
- Réaliser l’analyse génomique de familles de gènes impliquées dans la biosynthèse de biomolécules chez deux plantes médicinales, Coffea mauritiana et Psiadia dentata (génome disponible ou en cours de séquençage)
- Participer à la collecte des échantillons de feuilles en milieu naturel (forêts réunionnaises) en accompagnant l’ingénieur en charge de la constitution de l’échantillothèque végétale nécessaire au projet
- Rédiger des articles scientifiques à l’issue des analyses
- Participer au transfert des connaissances auprès des acteurs de la filière ‘plantes médicinales’ de La Réunion
Profil recherché
Vous avez développé les compétences suivantes :
- Maîtrise des approches de génétique/génomique des populations
- Connaissances en biostatistiques et génétique d’association pour tester les effets environnementaux
- Maîtrise des outils bioinformatiques et de langages de programmation (Python, R, …)
- Capacité rédactionnelle et communication en anglais
Vous faites preuve des qualités humaines suivantes :
- Rigueur
- Organisation
- Autonomie
- Aisance relationnelle
- Sens des responsabilités
- Esprit d’initiative
Vous possédez un diplôme Doctorat (niveau 8).
Une première expérience professionnelle dans le domaine est souhaitable.
Qui sommes-nous ?
L’Institut de recherche pour le développement (IRD) est un organisme de recherche public français pluridisciplinaire qui est fondé sur un modèle original de partenariat scientifique équitable avec les pays du Sud et une science interdisciplinaire et citoyenne, engagée pour la réalisation des Objectifs de Développement Durable.
Une science engagée
L’IRD co-produit une science d’excellence et d’exigence, de standard international, qui nourrit décisions et politiques publiques. Pour cela, l’IRD dispose de plus de 2200 femmes et hommes répartis au sein de 4 délégations régionales, 35 représentations en Outre-mer et à l’international et 79 unités mixtes de recherche. L’Institut est placé sous la double tutelle du ministère chargé de l’Enseignement supérieur et de la Recherche et celui de l’Europe et des Affaires Étrangères.
Notre mission
La mission première de l’IRD est de produire de la science focalisée sur la zone intertropicale et méditerranéenne et fondée sur un partenariat scientifique équitable avec les communautés d’enseignement supérieur et de recherche (ESR) des pays et régions concernés.
L’objectif est le renforcement des capacités propres de l’enseignement supérieur de la recherche (ESR) des pays partenaires. Cela vise à contribuer, d’une part, aux avancées de la science universelle, d’autre part, à la satisfaction des besoins de leurs populations, en particulier les plus vulnérables.
Ensemble, scientifiques et partenaires de l’Institut proposent des solutions concrètes pour répondre aux défis globaux auxquels les sociétés et la planète font face. Cette relation gagnante-gagnante fait de la science et de l’innovation des leviers majeurs du développement.
Descriptif du service
L’UMR DIADE vise à comprendre la diversification des plantes tropicales, qui constituent un des principaux réservoirs originaux de la biodiversité et pour lesquelles la conservation, la gestion et l’exploitation sont des enjeux majeurs pour un Développement Durable. Les activités que vous mènerez s’insèrent dans le cadre du projet Qualitiz (Projet Feder Réunion 2025-2028) porté par l’IRD (UMR DIADE) et l’Université de La Réunion (UMR PVBMT et laboratoire CHEMBIOPRO). Ce projet vise à étudier la diversité génétique des populations naturelles et cultivées d’une dizaine d’espèces médicinales, endémiques des Mascareignes, afin d’appréhender leur structuration génétique et fournir les connaissances nécessaires à leur valorisation et leur conservation. Pour trois espèces, des analyses génomiques et chimiques complémentaires seront menées afin d’identifier des génotypes performants, élucider les voies de biosynthèse des molécules bioactives ciblées, et identifier les pratiques culturales favorisant leur accumulation, ceci afin de proposer des solutions concrètes aux acteurs de la filière.
À propos de l'offre
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Vous serez intégré à l'équipe ADvENS de l’UMR Diade.
Vous serez accueilli au sein de la Plateforme 3P à Saint-Pierre.
Vous interagirez principalement avec les généticiens du projet (P. Lashermes, UMR Diade, Montpellier, et E. Garot, UMR PVBMT, Saint-Pierre), les physiologistes en charge de l’étude des voies de biosynthèse (T. Joët et S. Dussert, UMR Diade, Montpellier) et l’ingénieur en charge de la collecte des échantillons (CDD Qualitiz, Saint-Pierre).
Vous participerez aux réunions regroupant l’ensemble des acteurs du projet (UMR Diade, UMR ChemBioPro, UMR PVBMT et Armeflhor).
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Vacant à partir du 01/12/2025
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*Ingénieur écoconception*
