Ingénieur(e) en Biostatistique et Analyse de Données Génétiques (H/F)

Référence : UMR8199-HELDEG0-046

  • Fonction publique : Fonction publique de l'État
  • Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
  • Localisation : 59045 LILLE (France)
Domaine : Recherche
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  • Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
  • Nature du contrat Non renseigné
  • Expérience souhaitée Non renseigné
  • Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels Entre 2 521,95 € et 3 786,43 € € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
  • Catégorie Catégorie A (cadre)
  • Management Non renseigné
  • Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

Missions :
Le/la collaborateur/collaboratrice recherché(e) interviendra en amont (design expérimental, calcul de puissance) et en aval des études de type omiques et biologiques réalisées par le laboratoire. Il ou elle participera grâce à ses connaissances en statistiques et en analyse des données à répondre à des questions de recherche variées, et sera capable d’implémenter des idées rapidement et de créer des chaines de traitement reproductible.
Activités :
• Réalisation et interprétation des analyses statistiques utilisées dans les études génétiques (p. ex., régressions logistiques, régressions linéaires, analyses de survie, analyses de variance, score génétique).
• Développement et application de chaines de traitement de contrôle-qualité et d’analyse (de la collecte à l’analyse des données).
• Apporter le conseil aux chercheurs et ingénieurs dans la mise en œuvre des méthodes et des outils statistiques. (Déterminer les méthodes statistiques ainsi que les logiciels/extensions les mieux adaptés pour une étude donnée.)
• Rédaction de rapport d’analyses et des sections des articles scientifiques liées à la méthodologie statistique (p. ex., avec Rmarkdown, shiny ou quarto). Production de figures et de tables sur mesure (Avec des extensions ggplot2, gt, etc.).
• Participation à la veille technique et scientifique.

Contexte de travail :
L’unité Inserm U1283 / CNRS UMR 8199 ((Épi)génomique Fonctionnelle et Physiologie Moléculaire du Diabète et Maladies Associées) est un laboratoire de recherche regroupant 68 personnes dirigées par le Professeur Philippe FROGUEL. Elle fait partie de l’Institut Européen de Génomique du Diabète (EGID) et a été lauréate des appels à projets “Laboratoire d’Excellence” (LABEX) et “Équipement d’Excellence” (EQUIPEX LIGAN MP).
Site web : http://www.good.cnrs.fr
Le groupe biostatistique est en charge des analyses statistiques et contribue à l’élaboration du design des études, notamment dans le cadre des demandes de financements. Le groupe biostatistique comporte trois membres et est supervisé par Amélie Bonnefond et Stefan Gaget.
Que faisons-nous ?
Nos activités de recherche portent sur la caractérisation de variations génétiques associées à des maladies métaboliques telles le diabète et l’obésité et utilisent les approches modernes de génomique, bioinformatique, biostatistique, biologie moléculaire et modèles animaux.
L’objectif principal du groupe biostatistique consiste à apporter un soutien méthodologique fort aux différentes stratégies proposées par le laboratoire. Cela inclut, des développements méthodologiques et le développement d’outils (programmation), d’analyse et de visualisation, notamment pour les données issues des technologies de puce et de séquençage à haut débit (p. ex., NGS, RNA-seq, Methyl-array, etc.).
Site web : http://www.good.cnrs.fr/bio-informatique-bio-statistique/
Nos réalisations
Notre expertise dans l’utilisation du programme R (https://www.
Voir plus sur le site emploi.cnrs.fr...

Profil recherché

Competences :
• Formation supérieure (Master 2, ingénieur ou doctorale) en (bio)statistique, mathématique ou domaine apparenté - Expérience souhaitable, débutants acceptés selon profil.
• Maitrise théorique et appliquée des statistiques.
• Maitrise de la collecte et du traitement de données.
• Maîtrise du langage R avec ses outils de visualisation des données.
(connaissance de Shiny, ggplot2, targets et renv seraient un plus).
• Connaissance d’autres langages comme Python et/ou bash serait un plus.
• Programmer dans différents environnements informatiques (p. ex., UNIX/Linux, etc.).
• Appliquer un dispositif de contrôle de version (p. ex., Git).
• Rédiger de la documentation, des rapports d'analyses et tout ou partie d'article scientifique.
• Connaissance et/ou maîtrise de la génétique et épigénétique serait un atout.
• Expérience ou connaissance dans le développement de modèle (« machine learning », « bootstrapping », approches de régression etc.) et dans la réalisation d’analyse prédictive.
• Expérience de développement collaboratif à l’aide des outils git et docker.
• Langue anglaise : B1 à B2 (communication orale régulière et rapport écrit).
• Qualités organisationnelles (autonomie, respect des délais, anticipation des sources de retards, etc.), présentation synthétique et didactique des résultats scientifiques.
• Capacité (écrite et orale) de communication, être capable d’expliquer des résultats techniques à une audience non technique ou spécialisé dans le domaine.
• Goût pour le travail en équipe.

Contraintes et risques :

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 6 Licence/diplômes équivalents
  • Spécialisation Informatique, traitement de l'information, réseau de transmission des données

Langues

  • Français Seuil

Qui sommes-nous ?

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.

C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.

En savoir plus sur l'employeur

À propos de l'offre

  • Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

  • Vacant

  • Experte / Expert en information statistique

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