Post-Doctorant ERC KINTSUGI DUPIN F/H

Référence : 2025-2099466

  • Fonction publique : Fonction publique de l'État
  • Employeur : Université de Bordeaux
    Université de Bordeaux
  • Localisation : Pessac
Domaine : Recherche
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Date limite de candidature : 06/12/2025

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  • Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
  • Nature du contrat

    CDD de 2 ans
  • Expérience souhaitée Non renseigné
  • Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels 33 012 € brut/an € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
  • Catégorie Catégorie A (cadre)
  • Management Non renseigné
  • Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

Vous serez intégrez au sein du groupe  « BPCO » de l’équipe « Remodelage Bronchique », qui compte une dizaine  de personne sous la direction du Pr Isabelle Dupin. Vous serez impliqué dans le développement de l’atlas cellulaire de la niche des glandes sous-muqueuses pulmonaires et l’analyse transcriptomique à l’échelle de la cellule unique des modèles organoïdes. Ces analyses seront mises en relation avec des données cliniques, en particulier à l'état de résilience clinique du donneur dont les tissus/cellules ont été prélevés. Il·elle contribuera également à l’analyse spatiale et morphométrique des différentes structures bronchiques grâce à l’établissement d’un modèle basé sur l’intelligence artificielle exploitant des images H&E, et au développement des modèles mathématiques (en collaboration avec des mathématicien·nes).

Profil recherché

Nous recherchons un chercheur titulaire d’un doctorat. Un diplôme de bioinformatique et/ou et d’ingénieur·e dans le domaine de la biologie est un atout pour ce poste.

Cette fonction requiert :

·         Une expérience en analyse de données de transcriptomique spatiale et intégration avec des données unicellulaires

·         Une expérience en analyse d’images (logiciel Qupath si possible)

·         Une maîtrise de l'environnement Linux et des langages de programmation R, Python et Bash

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents

Localisation

Localisation : 146 Rue Léo Saignat 33076 Bordeaux

Qui sommes-nous ?

L’Université de Bordeaux est une grande université dynamique, responsable, attentive au bien-être de ses personnels. La rejoindre, c’est travailler dans un cadre privilégié au sein d’une communauté professionnelle particulièrement diverse et ouverte, en bénéficiant de dispositifs d’accueil et d’inclusion, de formation et de mobilité interne. C’est participer à une aventure académique, scientifique et humaine. C’est s’engager à relever les défis du XXIe siècle.

À propos de l'offre

  • Nous recherchons un chercheur titulaire d’un doctorat. Un diplôme de bio-informatique et/ou et d’ingénieur·e dans le domaine de la biologie est un atout pour ce poste.

    Cette fonction requiert :

    ·         Une expérience en analyse de données de transcriptomique spatiale et intégration avec des données unicellulaires

    ·         Une expérience en analyse d’images (logiciel Qupath si possible)

    ·         Une maîtrise de l'environnement Linux et des langages de programmation R, Python et Bash

    ·         Une maîtrise et une appétence pour les outils mathématiques et computationnels

    ·         Une connaissance de la physiologie respiratoire (non obligatoire mais appréciable)

    La maîtrise de l’anglais scientifique, des outils d’analyse statistique (Excel, GraphPad) ainsi que de bonnes capacités rédactionnelles pour la rédaction d’articles scientifiques sont attendues. Une expérience avérée dans le domaine de l’analyse transcriptomique à l’échelle de la cellule unique est souhaitée

    Au-delà des compétences techniques, nous recherchons une personne dynamique, curieuse, ouverte et dotée d’un bon sens de la communication, capable d’évoluer au sein d’un environnement interdisciplinaire et collaboratif.

  • L 332-2, 2° (ex 4-2)

  • Vacant à partir du 06/11/2025

  • Chercheuse / Chercheur

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