Post doctorant (H/F) - Pushing Cell

Missions :
Prendre part au consortium international « Pushing Cell » qui vise à comprendre les processus biologiques et physiques permettant à des cellules de se déplacer dans une matrice biologique sans pouvoir adhérer à cette matrice.
Nous cherchons un(e) physicien(ne) théoricien(ne) pour développer un modèle numérique permettant de comprendre les interactions mécaniques entre une cellule et son environnement en l'absence de force d'adhésion. La ou le postdoc sera chargé de la mise en place d'études numérique de l'interaction entre les filaments du cytosquelette et la membrane cellulaire, en particulier en réponse à des changement de topographie de celle-ci. L'outil numérique de base sera le logiciel cytosim, qui permet de simuler la dynamique de filaments tels que l'actine. La personne recrutée sera également impliquée dans le développement de modèles analytiques basés sur la théorie des gels actifs, en collaboration avec un(e) doctorant(e), et de la comparaison entre ces deux approches.
Activités :
Prise en main du logiciel cytosim. Vérification d'un certain nombre de résultats préliminaires sur la distribution de contraintes mécaniques exercées par une couche de filaments dynamiques sur une surface de topographie fixée
Intégration de la simulation d'une membrane fluide et déformable dans l'environnement cytosim. Simulation dynamique de la morphologie de la membrane en réponse au stress exercé par les filaments
Intégration de protéines sensibles à la topographie de la surface et modifiant la dynamique des filaments
Collaboration avec un(e) doctorant(e) chargé(e) du développement d'un modèle analytique de ce système
Collaboration avec des partenaires expérimentateurs (physiciens et biologistes) étudiant ces processus dans des systèmes in-vitro et in-vivo.
Contexte de travail :
La motilité cellulaire est généralement décrite comme étant basée sur des processus d'adhésion/détachement impliquant des protéines adhésion telle que les intégrines. Il est cependant reconnu depuis quelques années que des cellules ne possédant pas ces capacités d'adhésions peuvent néanmoins se déplacer dans des matrices tri-dimensionnelles, parfois à des vitesses plus élevées que les cellules adhérentes. Ceci semble suggérer que ces cellules se déplacent en poussant sur leur substrat. Nous nous sommes basés sur ces observations ainsi qu'un certain nombre d'études préliminaires pour construire un projet regroupant des équipes de biologie structural et de biologie cellulaire, une équipe de biophysiciens expérimentateurs, et une équipe de physiciens théoriciens. Ce projet consiste à déterminer les mécanismes d'autoassemblage des éléments du cytosquelette qui permettent à une cellule d'exercer des forces de poussée, en particulier en réponse à une stimulation extérieure qui modifie la topographie locale de la membrane cellulaire. A plus longue échéance, ces travaux seront intégrés à l'échelle de la cellule pour compren
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