Post-Doctorant (H/F) en traitement d'images et intelligence artificielle en IRM
Référence : UMR7348-CARGUI-003
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 86021 POITIERS CEDEX (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
- Nature du contrat Non renseigné
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels 2 991,58€ à 3 417,33 € brut mensuel € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Missions :
L’objectif de ce poste est de développer des méthodes novatrices pour le traitement et l'analyse des images d'IRM à 7Tesla de différentes modalités et formats (NIFTI, DICOM, etc) à l'aide de techniques d'apprentissage automatique et d'intelligence artificielle. Ces méthodes seront proposées pour l’amélioration de la précision des diagnostics médicaux, l'identification de biomarqueurs et la compréhension des caractéristiques du gliome dans les données d'IRM.
Activités :
Le/La candidat (e) sélectionné(e) travaillera en particulier sur le :
- Développement d’un pipeline de prétraitement des données médicales IRM a haut champ (normalisation, débruitage, recalage spatial) pour optimiser la qualité et la cohérence des données utilisées dans les analyses et faciliter la recherche des biomarqueurs dans des images 7T
- Développement d’algorithmes et de modèles d'intelligence artificielle pour le traitement et l'analyse des images/spectre obtenus en IRM, en mettant l'accent sur la détection des tissus tumoraux et la quantification des métabolites obtenus dans la lésion et la corrélation avec les données cliniques et de l’anatomo-pathologie.
Contexte de travail :
Le/la post doctorante recruté(e) travaillera sur la plateforme ultra haut champ du CHU de Poitiers au sein de l'équipe DACTIM-MIS du Laboratoire de Mathématiques et Applications (LMA, CNRS 7348) de l'Université de Poitiers dans le cadre du projet région GLIOSRM7T qui porte sur la caractérisation pré-chirurgicale de l’extension des gliomes à l’aide de la spectroscopie par résonance magnétique en IRM 7T. Une partie de ce projet s'intéresse au développement des outils de traitement d'images IRM, de la mise en place de modèles mathématiques d'analyse des données de spectroscopie, puis d'intégrer et de contextualiser les données d'imagerie multimodale pour l’aide au diagnostic.
Le candidat sélectionné travaillera en étroite collaboration avec des équipes multidisciplinaires comprenant des radiologues, des médecins et des ingénieurs, des mathématiciens pour valider et évaluer les modèles développées. Les résultats obtenus seront comparés à des références cliniques/précliniques et interprétés de manière médicalement pertinente.
Profil recherché
Competences :
Profil recherché : Docteur en Informatique ou Traitement des images et du signal
Compétences requises :
· Programmation informatique médicale : python, 3D slicer, LCmodel (optionnel), FSL, spm, ants
· Compétences en Intelligence artificielle et expérience en apprentissage profond
· Maitrise des plateformes d’apprentissage profond Tensorflow/Pytorch/scikitlearn
· Connaissance en biologie et méthodes d'imagerie médicale : IRM, SRM
· Anglais : haut niveau
Contraintes et risques :
pas de risque ni contraintes
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
- Spécialisation Formations générales
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Chercheuse / Chercheur
