Post-Doctorant (H/F)

Missions :
Des études d’association pangénomique (GWAS) sur plusieurs caractères d’intérêt liés au développement du haricot dans différents environnements ont été réalisées ainsi qu’une méta-analyse GWA qui a permis d’identifier les locus impliqués dans les interactions GxE.
Le post-doctorant recruté aura pour mission de :
• Réfléchir sur la prise en compte de l’admixture entre les pools génétique andins et mésoaméricains dans la GWA
• Explorer le chevauchement potentiel entre les locus d’interactions GxE et les locus d’association environnementale, afin d’identifier les polymorphismes génétiques impliqués dans la réponse à des signaux environnementaux spécifiques.
• Développer des modèles de prédiction génomique pour plusieurs caractères d’intérêt liés au développement et à la croissance du haricot, et analyser le gain potentiel d’inclure les locus identifiés par GWA dans ces modèles.
• Utiliser la sélection génomique (GS) pour prédire les performances dans un panel plus large et identifier parmi ce panel des sources originales de diversité.
Activités :
Analyse des mécanismes génétiques de l'adaptation environnementale chez le haricot commun
Contexte de travail :
Dans le contexte des changements climatiques, un enjeu majeur en amélioration des cultures est de développer des variétés adaptées aux contraintes environnementales pour garantir la sécurité alimentaire humaine. Les informations moléculaires désormais disponibles pour de nombreuses espèces permettent d’identifier les loci impliqués dans la variation de caractères complexes grâce aux études d’association pangénomique (GWAS) et d’améliorer l’efficacité des schémas de sélection via des modèles de prédiction en sélection génomique (GS). Une fois calibrés sur des individus à la fois phénotypés et génotypés, les modèles GS permettent de prédire les performances des plantes dans des environnements où elles n’ont pas encore été observées, et d’identifier des sources originales de diversité. L’application des GWAS et de la GS aux cultures comme le haricot commun (Phaseolus vulgaris) devrait permettre d’améliorer les stratégies de sélection et d’augmenter la productivité des cultures.
Le projet INCREASE [1] combine des approches de pointe en génétique et génomique des plantes, un phénotypage à haut débit, y compris le phénotypage moléculaire (transcriptomique et métabolomique, par exemple), afin de renforcer la conservation des ressources génétiques des légumineuses alimentaires européennes, notamment le haricot commun, et d’en promouvoir l’utilisation et la valorisation.
Dans ce projet, des données phénotypiques sur plus de 450 lignées séquencées de haricot commun ont été collectées dans six environnements bien caractérisés (T-core). Ces données offrent l’opportunité de mieux comprendre les réponses de ces lignées à divers environnements, d’étudier le déterminisme génétique de ces réponses et de développer des modèles de prédiction GS. Le c
Voir plus sur le site emploi.cnrs.fr...