Post-doctorant/post-doctorante (H/F) : métabolisme de polysaccharides chez les algues brunes

Missions :
Objectif.
Caractérisation biochimique d’enzymes clés impliquées dans le métabolisme de l'alginate chez les algues brunes. La méthodologie appliquée fera appel à la production et à la caractérisation des enzymes recombinantes correspondantes.

État des lieux
Les algues brunes sont des éléments essentiels des écosystèmes côtiers [1]. Elles représentent une biomasse riche mais sous-exploitée qui a un rôle à jouer pour relever les défis mondiaux [2]. Elles sont également largement exploitées pour l'extraction de l'alginate, utilisé dans l'industrie des hydrocolloïdes [3]. L'alginate est un polysaccharide essentiel de la paroi cellulaire des algues brunes, et un acteur clé dans les fonctions biologiques chez ces organismes [4]. Paradoxalement, nous n'avons qu'une compréhension partielle du métabolisme de ce polysaccharide, par des ‘enzymes actives sur les carbohydrates’ ou CAZymes. Bien que nous ayons identifié de nouveaux gènes candidats [5,6], la caractérisation biochimique des protéines correspondantes reste à établir.

[1] Pessarrodona A et al. (2022). Science Advances 8, eabn2465. https://doi.org/doi:10.1126/sciadv.abn2465
[2] Farghali M et al. (2022) Environmental Chemistry Letters 21, 97-152. https://doi.org/10.1007/s10311-022-01520-y
[3] Hurtado A, (2022). International Journal of Molecular Sciences 23, 4486. https://doi.org/10.3390/ijms23094486
[4] Mazéas L et al. Seminars in Cell & Developmental Biology 134, 112-124. https://doi.org/10.1016/j.semcdb.2022.03.005
[5] Denoeud F, et al. (2024). Cell 187, 6943-6965.e6939. https://doi.org/10.1016/j.cell.2024.10.04
[6] Mazéas et al. (2024). BMC Genomics 25, 950. https://doi.org/10.1186/s12864-024-10811-3

Activités :
• Analyse des gènes candidats à partir de la vaste base de données génomiques interne pour les algues brunes, Phaeoexplorer.
• Etablir et commander les séquences à synthétiser pour une future expression hétérologue.
• Tester l'expression dans des systèmes hétérologues modèles procaryotes et/ou eucaryotes.
• Optimiser les conditions de culture pour améliorer l'expression soluble des protéines.
• Effectuer la caractérisation biochimique des enzymes produites. Trois familles distinctes de CAZymes sont ciblées, couvrant des activités biochimiques distinctes.
• Interprétation et valorisation des résultats (publication(s), conférences)

Contexte de travail :
Le poste est financé par la région Bretagne et sera dirigé par le Dr Cécile Hervé, responsable de l’équipe Polysaccharides des Algues Brunes dans l’unité de Biologie Intégrative des Modèles Marins à la station Biologique de Roscoff. L’unité dispose d'une renommée internationale dans les études en biologie intégrative sur les macroalgues. Elle est située au sein de la Station Biologique de Roscoff, un centre de recherche et d'enseignement marin qui emploie environ 300 personnes dans un petit village de la côte nord de la Bretagne (Roscoff), en France.

Les protéines d’alg
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