Post-doctorat (H/F) - Bioinformatique du tissu musculaire

Référence : UMR5261-FABLEG-013

  • Fonction publique : Fonction publique de l'État
  • Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
  • Localisation : 69008 LYON 08 (France)

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  • Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
  • Nature du contrat Non renseigné
  • Expérience souhaitée Non renseigné
  • Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) à partir de 3021 € bruts mensuels selon expérience € brut/an
  • Catégorie Catégorie A (cadre)
  • Management Non renseigné
  • Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

Missions :
Le contrat postdoctoral de 2 ans, renouvelable, est disponible pour mener un projet collaboratif financé par l'ANR. Les fibres musculaires sont des cellules syncytiales multinucléées, reconstruites par la fusion des cellules souches musculaires. Notre objectif est de comprendre comment le processus de régénération est régulé pour reconstruire correctement un muscle endommagé.
Activités :
Notre laboratoire étudie la régulation moléculaire du processus de régénération chez la souris adulte. Nous avons récemment effectué un séquençage d'ARN à événement unique sur des noyaux extraits de muscles blessés (https://doi.org/10.1101/2024.07.22.604619)
Bien que l'ensemble de données ait déjà été prétraité, le post-doc analysera les données des noyaux uniques en interaction avec les bioinformaticiens de l'équipe. Il/Elle effectuera la cartographie des groupes nucléaires. L'analyse en composantes principales pour l'expression des gènes et l'analyse sémantique latente pour l'accessibilité de la chromatine pré-sépareront les populations de noyaux. Le regroupement des données des noyaux uniques, permettra ensuite d'identifier les états transitoires entre les cellules mononucléées et les myotubes multinucléés différenciés.
Contexte de travail :
Le projet sera mené dans l'équipe de de Fabien Le Grand au sein de l'UMR 5261 de l'Institut NeuroMyoGène, à Lyon (France). Le laboratoire est situé au 3ème étage de la Faculté de Médecine Lyon-Est. Il est composé de 12 équipes de recherche qui ont accès à des plateaux techniques internes ou mis à disposition par l'UAR 2204.

Profil recherché

Competences :
Le/la post-doctorant(e) mènera son propre projet, contribuera à d'autres projets sur une base collaborative et guidera les doctorants dans leurs recherches. Le/la candidat(e) doit faire preuve de créativité et de dynamisme en plus des éléments suivants : - Doctorat en biologie cellulaire - Expérience en bioinformatique - Expérience pratique en imagerie et compréhension des méthodes d'analyse d'images - Antécédents de rédaction d'articles, comme en témoignent les publications ou un manuscrit soumis - Compétences en communication, notamment à l'interface de la biologie cellulaire et de la biologie quantitative Les candidat(e)s doivent fournir CV, lettre de motivation et le contact e-mail des référents.
Contraintes et risques :
Risques standards liés à la culture de cellules.

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
  • Spécialisation Formations générales

Langues

  • Français Seuil

Qui sommes-nous ?

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.

C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.

En savoir plus sur l'employeur

À propos de l'offre

  • Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

  • Vacant
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