Post-doctorat (H/F) En modélisation des systèmes chimiques prébiotiques multistables spatialisés

Missions :
Ce poste est ouvert dans le cadre le l’ANR EmergeNS dont l’objectif est de comprendre, à travers des modèles mathématiques et informatiques, le rôle qu’ont pu jouer l’autocatalyse, la multistabilité et l’hétérogénéité spatiale dans l’émergence de la sélection naturelle. Dans ce projet, nous nous intéressons donc à des systèmes chimiques prébiotiques, avec le prisme de théories classiques en écologie et en évolution (interactions écologiques, dynamique d’invasion, hérédité non-génétique).
Dans ce cadre, l’un des aspects les plus pertinents des systèmes prébiotiques ouverts est leur tendance à rester bloqués dans certaines configurations stationnaires. Dans un environnement homogène, les configurations les plus rencontrées seront celles qui montrent la stabilité la plus grande. Si différentes localités peuvent être dans des configurations différentes, alors d’autres caractéristiques pourraient influer sur la probabilité de rencontrer chaque configuration, liées à leurs capacités à envahir les localités voisines.
La personne recrutée aura pour mission de développer des outils mathématiques et informatiques visant à (i) identifier les configurations stables possibles, (ii) caractériser leur stabilité dans un contexte homogène, en particulier les probabilités de transitions entre ces configurations, (iii) identifier comment le voisinage (dans un contexte spatialisé) influence les configurations stables et leur stabilité, (iv) simuler la dynamique de certains systèmes d’intérêt dans un contexte spatialisé.

Activités :
La personne recrutée devra :
- développer des outils d’analyse de systèmes chimiques multistables, en mettant à profit des méthodes récentes (action functional gradient descent, Gagrani & Smith Phys. Rev. E 2023)
- developper un modèle permettant de prendre en compte l’influence du voisinage sur la stabilité de différentes configurations stables
- étudier des systèmes jouets dont les paramètres permettent de modifier la stabilité et les capacités d’invasion de différentes configurations stables
- développer un outil de simulation spatialisé permettant de tester des scénarios établis à partir des approches ci-dessus
- intégrer l’ensemble de ces outils dans la plateforme EmergeNS, en vue d’une mise à disposition libre


Contexte de travail :
La personne recrutée rejoindra l’équipe Evolution, Adaptation, Comportement du LBBE, à laquelle Etienne Rajon (MCU) appartient. L’équipe dédiée au projet est répartie sur différents sites : Denis Kuperberg est CR CNRS au LIP, ENS Lyon, et Sylvain Charlat est CR CNRS au laboratoire PIMIT à Saint-Denis de la Réunion. La personne recrutée sera amenée à interagir fréquemment avec Iris Magnier--Papillon, en thèse sur d’autres aspects du projet au LIP et avec d’autres étudiants qui seront recrutés au cours du contrat. Nos interactions se font systématiquement en visio avec la Réunion, mais les membres lyonnais du projet se rencontrent réguli
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