Postdoc en biochimie computationnelle H/F
Référence : UMR7019-EMMBIG-003
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 54506 VANDOEUVRE LES NANCY (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
- Nature du contrat Non renseigné
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) Entre 3000€ et 4000€ bruts mensuels selon expérience € brut/an
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Missions :
- Simulations QM/MM-MD
- Méthodes d'échantillonnage préférentiel et calculs d'énergie libre
- Rédaction de publications
- Présentations orales et par posters dans des congrès internationaux
- Encadrement de stagiaires
Activités :
Dans les cellules, l'activité des gènes est étroitement contrôlée par des modifications chimiques réversibles, qui sont de divers types et modulent l'accessibilité des gènes sans affecter la séquence d'ADN. La modification des protéines histones, responsables de la compaction de l'ADN dans le noyau, en fait partie. Comprendre comment ces changements impactent la compaction de l'ADN (du nucléosome aux structures de la chromatine) et le fonctionnement du génome est un domaine de recherche d'actualité, mais plusieurs aspects souffrent d'un manque critique de données et restent insaisissables aux outils expérimentaux.
Ce projet postdoctoral vise à élucider les mécanismes de formation de la modification de la S-glutathionylation dans le contexte du nucléosome. S'il a été démontré que le résidu cystéine de l'histone H3 peut être S-glutathionylé in vitro et in vivo (voir García-Giménez et al Free Rad Biol Med 2021), les processus dynamiques permettant au réactif de se positionner dans un état pré-réactif et les mécanismes réactionnels à l'origine du processus de S-glutathionylation lui-même restent inconnus. En recourant aux approches QM/MM-MD, à l'échantillonnage amélioré et aux calculs d'énergie libre, les voies de réaction conduisant à la formation de glutathionylation de l'histone H3 seront élucidées.
Cette recherche fournira des informations inédites sur les mécanismes de formation des modifications des histones, ouvrant des perspectives importantes pour la compréhension de la compaction de l'ADN et de la régulation de l'expression génétique.
Contexte de travail :
Ce contrat postdoctoral s'inscrit dans le cadre du projet CHROM, financé par l'Agence Nationale de la Recherche (ANR, ID ANR-24-CE29-2473).
La/le candidat.e travaillera au Laboratoire de Physique et Chimie Théorique à Nancy (France).
Le laboratoire LPCT s'engage à promouvoir un milieu de travail inclusif.
Profil recherché
Competences :
Titulaire d'un doctorat, avec une formation en chimie computationnelle/biochimie. Un vif intérêt pour les applications aux systèmes biologiques et une expérience documentée des approches QM/MM(-MD) sont requis.
De bonnes compétences en programmation et une connaissances des techniques de calculs d'énergie libre et d'échantillonnage référentiel seraient fortement appréciées.
Contraintes et risques :
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
- Spécialisation Formations générales
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Chercheuse / Chercheur